温岭市非综合征型听力损失致病基因突变频谱及临床表型分析

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研究背景及目的:听力损失是重要的全球公共卫生问题。据世界卫生组织估计,2020年全世界约有4.66亿残疾性听力损失患者,占全世界人口的5.5%。听力损失不仅严重影响患者的生活质量,还给社会经济发展造成严重负担。听力损失主要由遗传、环境及其相关作用导致,其中约50%的听力损失由遗传因素造成,因此,探究听力损失的遗传背景是听力损失预防和控制的关键。对象与方法:研究对象来自温岭市遗传性听力损失基因数据库,共纳入173例非综合征型听力损失(NSHL)先证者以及201例先证者的直系亲属。采用定制的靶向panel检测研究对象的246个听力损失相关基因,对检测到的突变进行生物信息学分析,并使用率和构成比对GJB2、SLC26A4以及线粒体12S r RNA基因突变分布情况进行描述,使用卡方检验比较上述基因突变的组间携带率。运用统计学方法分析基因型与疾病表型之间的关联,采用卡方检验比较不同致病基因携带者的外显率、发病年龄、听力曲线差异;采用Wilcoxon秩和检验与有序logistic回归分析GJB2基因截短突变和非截短突变NSHL患者听力损失严重程度差异;采用多因素logistic回归探究线粒体12S r RNA基因突变携带者听力损失外显率的影响因素。结果:60.16%(225/374)的研究对象携带听力损失致病基因突变,温岭籍与非温岭籍家系的致病基因携带率无差异,均以GJB2基因为主要致病基因,其次为线粒体12S r RNA与SLC26A4基因。41.98%(157/374)的研究对象携带GJB2基因突变,主要突变类型为c.235del C、c.109G>A,其等位基因频率分别为12.17%(91/748)和11.36%(85/748);7.22%(27/374)的研究对象携带SLC26A4基因突变,主要突变类型为IVS7-2A>G,其等位基因频率为1.47%(11/748);18.18%(68/374)的研究对象携带12S r RNA基因突变,其中18例研究对象携带m.1555A>G突变,携带率为4.81%(18/374)。与线粒体12S r RNA基因突变相比,GJB2基因突变表现为更高的疾病外显率(P<0.001)与更早的发病年龄(P=0.005,OR=4.181);线粒体12S r RNA基因与GJB2基因突变均表现为斜坡型和平坦型听力曲线(P=0.340);相比于非截短型突变,GJB2基因截短型突变更易于引起严重的听力损失(P<0.001,OR=48.012);氨基糖苷类抗生素暴露史(P<0.001,OR=18.518)、伴随其他基因突变(P<0.001,OR=14.723)为线粒体12S r RNA基因突变携带者发生听力损失的危险因素。结论:温岭市NSHL常见致病基因依次为GJB2、线粒体12S r RNA、SLC26A4基因。遗传性听力损失表现出明显的疾病异质性,不同基因突变可表现出相同的表型,同一基因突变也可表现为不同的表型,明确基因型与表型之间的关联是确诊的关键。本研究基于NGS技术与生物信息学手段,揭示听力损失的遗传背景规律,为听力损失基因筛查程序的完善提供了数据支持。
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