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中医药是中华民族的瑰宝,保健类中药材在我国食品产业和现代医疗体系中占有重要位置。近年来,中药材中真菌及真菌毒素污染受到国内外广泛关注,对消费者健康及中药产业发展造成潜在威胁。本文基于DNA宏条形码技术对5种保健类药材表面真菌进行鉴定研究,分析真菌多样性,探究真菌污染影响因素。具体方法如下:采集药材表面真菌群落总DNA;扩增核糖体RNA内部转录间隔区2(ITS2)序列;基于Illumina MiSeq PE 300平台检测ITS2序列;序列经质量控制及拼接后,进行聚类分析;分析真菌群落多样性、物种组成及差异性等。研究的主要内容和结果如下:1、当归药材表面真菌鉴定研究。从我国5个当归主产地收集到15份样品,检测发现样品均被真菌污染。其中子囊菌门Ascomycota(14.89%~99.57%)、锤舌菌纲Leotiomycetes(0.19%~84.97%)、柔膜菌目Helotiales(0.19%~65.60%)及小双腔菌科Didymellaceae(0.26%~74.68%)为优势菌群。枝孢霉属Cladosporium、镰刀菌属Fusarium及青霉属Penicillium分布于所有样品。除ASRY3和ASRH1样品外,曲霉属Aspergillus和根霉属Rhizopus在其他所有样品中均有检出。此外,本研究共检到4种产毒真菌(草酸青霉Penicillium oxalicum、短密青霉P.brevicompactum、橘青霉P.citrinum 及棒曲霉Aspergillus clavatus)和 1 种人类致病菌(Sarocladium strictum)。2、西洋参药材表面真菌鉴定研究。从我国5个西洋参主产地采集的15份药材均检出真菌。毛霉门 Mucoromycota(13.53%~57.81%)、Mucoromycetes(13.86%~57.81%)、毛霉目 Mucorales(13.53%~57.81%)和根霉科Rhizopodaceae(13.86%~57.79%)为优势菌群。根霉属(13.86%~57.79%)、曲霉属(6.05%~35.59%)和镰刀菌属(2.62%~12.44%)为优势菌属。除PQBJ1和PQSX3样本外,青霉属分布于其他所有样品,其中PQSD2样本的相对丰度最高。研究共检出6种人类致病菌:热带假丝酵母Candida tropicalis、近平滑假丝酵母 C.parapsilosis、C.palmioleophila、涎沫念珠菌C.zeylanoides、马拉色菌Malassezia restricta 及 M.globose。3、何首乌药材表面真菌鉴定研究。从我国5个主要药材市场收集到18份何首乌样品,其中3份为制何首乌样品。分别根据收集地区及加工方式进行分组,发现样品组间真菌群落的组成存在显著差异。结果发现18份样品均检出真菌。子囊菌门(71.55%~99.77%)、散囊菌纲 Eurotiomycetes(6.30%~98.07%)、散囊菌目Eurotiales(2.57%~98.07%)、曲霉科 Aspergillaceae(3.77%~97.91%)及曲霉属(2.14%~94.05%)为优势菌群。共鉴定到6种产毒真菌(黄曲霉A.flavus、红绶曲霉 A.nomius、溜曲霉 A.tamarii、腐皮镰刀菌 Fusarium solani、覃青霉 P.paxillin及岐皱青霉P.steckii)和1种人类致病菌(C.tropicalis)。4、川贝母药材表面真菌鉴定研究。从5个主要药材市场采集15份川贝母样品,结果显示样品均被真菌污染。子囊菌门(41.58%~99.66%)、散囊菌纲(8.49%~63.93%)、散囊菌目(8.49%~63.53%)及曲霉科(8.49%~63.51%)为优势菌群。曲霉属(8.49%~63.41%)、根霉属(0%~57.42%)、镰刀菌属(0%~22.81%)为优势菌属。共鉴定到 5 种产毒真菌:P.brevicompactum、P.citrinum、P.oxalicum、粉红单端孢霉Trichothecium roseum及局限曲霉A.restrictus。5、金银花药材表面真菌鉴定研究。从5个金银花主产区采集了 18份样品,分别根据不同产地和加工方式进行分组,组间差异性分析显示样品组间真菌组成存在显著差异。18份金银花样品均被真菌污染,子囊菌门(20.77%~88.41%)、Mucoromycetes(6.40%~79.23%)、毛霉目(6.40%~79.23%)及根霉科(6.40%~79.23%)为优势菌群。所有样品均被根霉属和曲霉属污染。除LJFHB3样品外,镰刀菌属也几乎遍布所有样品。此外,检出10种人类致病菌:C.tropicalis、C.parapsilosis、清酒假丝酵母 C.sake、M.restricta、合轴马拉色菌 M.sympodialis、海洋酵母Kodamaea ohmeri、长孢洛德酵母Lodderomyces elongisporus、裂褶菌Sc hiz ophyllum commune、Wallemia sebi及卷枝毛霉Mucor circinelloides。本研究可为监测保健类药材的真菌污染提供参考,进而为后期可能发生的真菌毒素污染问题提供早期预警,对中药材标准化生产及公众安全用药具有重要意义。