龙眼(Dimocarpus longan Lour．)起源于我国南部及越南北部。我国龙眼种质资源丰富，龙眼的分类涉及了形态学、孢粉学、生物化学、分子生物学等领域，经历了从形态多样性到DNA多样性的发展过程。由于分类标准不统一、分类手段的局限性，导致分类结果不一致。龙眼物种本身长期的自然杂交，种间类型多，部分品种来源不清，品种亲缘关系不明，同物异名及同名异物现象十分普遍，不利于龙眼种质资源的研究和品种的选育与推广。作者于2000年7月～2001年12月在广东省农科院果树所省重点实验室首次采用AFLP技术对龙眼种质材料进行种质鉴定、品种分类、亲缘关系、遗传多样性等方面的研究。主要研究结果如下： 1．改良常规的CTAB和SDS法提取龙眼叶片DNA，在提取液和裂解液中都加入抗氧化剂，并依材料不同新鲜度提出不同抗氧化剂浓度组合。所得DNA进行AFLP分析，指纹图谱清晰。 2．选用两对引物组合EcoRⅠACT+MseⅠCTT和EcoRⅠACT+MseⅠCTC对46份龙眼材料进行AFLP分析，共得到扩增位点111个，其中多态性位点103个，多态性比例达92.69％，区分率达100％。说明两对引物用于龙眼种质资源AFLP分析是可行的。 3．对46份龙眼材料DNA扩增结果进行聚类分析，依据相似系数0.76的水平可将供试材料分为11个品种群。本研究结果可以作为龙眼分类的依据和基础。 4．供试各品种的相似系数变化范围为0.62～0.93。多态性比例介于0.2703和0.4955间。大部分品种多态性比例介于0.3000～0.4000之间。表明在分子水平上，龙眼品种之间的遗传多样性不如香蕉、荔枝丰富。 5．福建东壁与广东东壁应为同一品种的不同晶系；双孖木与青皮应为不同的品种；迟龙眼为水眼的变异系；早熟一号为一个新的品系。