党的十八届三中全会提出,探索建立与行政区划适当分离的司法管辖制度;十八届四中全会提出,探索设立跨行政区划的人民法院,办理跨地区案件。在此背景下,行政案件跨行政区划集中管辖制度应运而生,跨行政区划集中管辖行政案件打破了司法管辖区域和行政管理区域的重叠,降低法院对所在地方形成的依附性,消除了当事人的思想顾虑,让群众依法通过诉讼方式解决行政争议的渠道更加畅通,从而提升司法公信力,通过司法监督促进法治政府建设。在改革试点工作开展以来,一度困扰行政诉讼的“立案难”“审理难”“执行难”得到了有效解决,跨行政区划法院的司法公信力得到有效提升。但在试点过程中,也确实发现了存在的现实障碍。通过认真总结国内实践成果,在系统比较外国制度经验的基础上,找到完善我国行政案件跨行政区划集中管辖制度的方案就显得非常重要。本文主要通过如下三个部分展开思考和论证:第一部分,行政案件跨行政区划管辖概述。主要对跨行政区划管辖制度作简要介绍,分析该制度设立的意义、特点,并阐述我国行政案件跨行政区划管辖制度的依据。第二部分,行政案件跨行政区划管辖制度的现状及运行中存在的问题。主要以L铁路运输两级法院跨行政区划审理行政案件的实际情况为例,总结跨行政区划管辖制度的现状,并提出运行中出现的各种问题,同时对问题成因做简要分析。第三部分,跨行政区划管辖制度的未来发展对策建议。主要对问题提出本文的对策建议,主要包括如何解决审判中取证难、申诉信访维稳问题;如何降低司法成本和实现司法便民;如何应对新形式的地方保护主义以及对审判队伍不稳定及裁判实效等问题提出意见和建议。