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目的:建立实时定量逆转录聚合酶链反应(RQ-PCR)检测慢性粒细胞白血病(CML)bcr/abl融合基因的方法,为CML临床诊断及微小残留病(MRD)监测提供重要诊断依据。
方法
采用传统的逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增K562细胞管家基因GUS及融合基因bcr/abl,以梯度稀释的扩增产物为标准品构建标准曲线,建立RQ-PCR方法检测bcr/abl融合基因,并评价此方法的检测限度、灵敏度、稳定性和可靠性。定量检测19例CML患者的外周血或骨髓样本中bc/abl融合基因表达水平,并用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析扩增产物类型。
结果
建立的GUS和bcr/abl标准曲线相关系数达到0.999以上;RQ-PCR方法最低限度可检测出约10<-5>μgK562总RNA中的bcr/abl融合基因,重复性和稳定性实验的CT值变异系数(CV)分别为:2.59%,3.25%;在19例CML患者中18例bcr/abl融合基因检测结果为阳性,灵敏度为94.7%;正常对照未检测到扩增,假阳性率为0%。19例CML患者中,16例Ph染色体阳性(Ph+)者bcr/abl融合基因表达均为阳性;3例Ph-中,2例为其它染色体异常经RQ-PCR方法检测bcr/abi融合基因阳性,另1例Ph染色体和bcr/abl融合基因同为阴性。18例bcr/abl融合基因阳性患者,其融合基因表达量相对值的范围为1.20×10<-4>-3.90×10<-1>,中位数为1.58×10<-2>。慢性期、加速期和急变期CML患者bcr/abl融合基因表达量相对值分别为(1.22±1.50)×10<-2>、(1.72±0.86)×10<-1>和(2.87±0.90)×10<-1>,三者的bcr/abl融合基因表达水平呈递增趋势,差异有显著性(P<0.05)。18例融合基因阳性扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,b3a2(+)为66.7%(12/18),b2a2(+)为27.8%(5/18),b3a2+b2a2(+)为5.5%(1/18)。
结论
1、Ph染色体及bcr/abl融合基因均为CML重要的诊断指标;2、RQ-PCR方法检测CML患者的bcr/abl融合基因,灵敏度高,重复性好,阳性检出率为94.7%,高于细胞遗传学方法;3、bcr/abl融合基因表达水平的改变与临床疾病进展关系相一致,有助于反映白血病细胞负荷、评价疗效及判断疾病预后;4、可以检测出b3a2和b2a2两种类型的融合基因转录本,能够广泛用于临床CML的诊断和病人治疗过程中MRD的检测。