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首先,利用1990-2000年长江流域农业区县级统计数据、同期TM遥感影像基础上获取的矢量数据、学术刊物和文献资料上发表的相关数据以及IPCC发布的和其他转换数据等为基本数据源,在建立的农业区氮平衡变化模型的基础上,以GIS技术等为手段,计算长江流域各县从1990年到2000年的氮平衡变化,然后汇总出全流域氮的输入、输出及剩余量。计算结果显示,全流域农业区1990年N的输入量为7.65×10~6t/a,输出量为4.23×10~6t/a,剩余量3.42×10~6t/a,其中进入水体量为2.05×10~6t/a,残留在土壤中量为1.37×10~6t/a;到2000年全流域农业区N的输入量为10.22×10~6t/a,输出量为5.44×10~6t/a,剩余量4.78×10~6t/a,其中进入水体量为2.65×10~6t/a,残留在土壤中量为2.13×10~6t/a。1990年到2000年长江流域农业区氮输入变化量为2.57×10~6t/a,氮输出量变化为1.21×10~6t/a,剩余量变化1.36×10~6t/a,其中进入水体氮变化量为0.60×10~6t/a,氮残留在土壤中变化量为0.76×10~6t/a。研究长江流域氮平衡变化以及对水体污染的影响,分析得出主要由于化学肥料的氮输入变化,重庆、上海、武汉、无锡、南昌、唐河、新野、襄阳、成都、遂宁地区氮进入水体量变化较大,为长江流域农业区水体氮污染重点防治区。为有效地防治长江流域农业区非点源氮污染,可采取最佳管理措施,从源头和径流减少农业非点源氮的产生;并还应借助相应的宣传教育、法规、技术、经济等手段,保证农业非点源氮污染得到有效地控制。其次,利用2001-2005年三峡库区农业区县级统计数据、矢量图,结合以上方法,分析得出三峡库区近年来(2001年、2003年和2005年)氮负荷与三峡水库农业区水体氮污染防治重点区域:长寿区、石柱县、武隆县、江津市、丰都县、巴东县、宜昌县、兴山县和巴南区。最后,利用三峡库区小江上游东河流域2003年1月1日到2004年12月31日逐日气象数据、土地利用类型、土壤类型、DEM等数据,经过SWAT模型营养盐模拟,得出东河流域单位面积上7月、9月表面冲刷NO3较大; 4、7、8、9月有机N负荷较大。经过进一步的验证并对参数进行校准,SWAT模型可推广到三峡库区甚至整个长江流域。