近年来，随着经济体制改革与政治体制改革的逐步推行，政府日益退出了市场领域和社会领域，为我国行业协会提供了不少发展空间。作为社会领域的多元治理主体之一，行业协会在完善市场运作机制、规范市场竞争秩序、维护企业会员利益,特别是在承接政府职能、协助政府管理等方面发挥着明显的作用，并日渐与地方政府形成一种合作关系。然而，这种关系却略显尴尬：在双方的合作中，地方政府制约着行业协会的合法性地位、资源的获取以及功能的发挥；行业协会由于自身能力不足，对地方政府的协助、参与和监督远远不够,双方呈现出一种不平等的合作关系。这与政府对行业协会的认识偏差、政府职能转变的不到位、现行行业协会管理体制的不科学以及我国公民社会发育的不成熟、不完善等因素密不可分。因此，行业协会与地方政府应如何实现合作就不得不被考虑。本文提出了行业协会与地方政府合作所应实现的总目标与所应遵循的原则，并指出二者可以在资源获取、政策倡导及公共服务等层面进行合作。在此基础上，针对行业协会与地方政府合作关系中存在的问题及原因，从转变地方政府治理理念、加快地方政府职能转移、创新行业协会管理体制、加强行业协会自治建设等方面提出实现二者有效合作的路径。