本研究在前人研究的基础上，建立了适用于中国明对虾和玻璃海鞘的染色体制备、探针标记以及原位杂交的技术体系，成功地将荧光原位杂交技术应用到中国明对虾和玻璃海鞘基因的定位和染色体的分析中，为了解对虾和海鞘的染色体核型、基因定位、物理图谱构建以及系统进化等遗传学问题奠定了基础。本论文以中国明对虾和玻璃海鞘的胚胎为材料，制备了形态完好的染色体，并进行了染色体核型分析，得到了中国明对虾核型公式为：2N=88=62M+16SM + 6ST+2T,NF=174；海鞘核型公式为：2N=28=18M+6SM+2ST+2T,NF=54。结合对减数分裂染色体分裂相的观察，认为中国明对虾中的点状染色体为端部着丝粒染色体。首次将两个高保守的功能基因定位在中国明对虾染色体上。即热休克蛋白70基因（hsp70）定位在对虾基因组中的3对同源染色体上，肌动蛋白基因则位于对虾基因组中的两对同源染色体上，其中一对染色体上有3个位点。同时对玻璃海鞘中肌动蛋白基因的位点也进行了定位，结果表明，该基因在玻璃海鞘的基因组中仅位于一对同源染色体上。