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目的:卵巢癌是妇科所有恶性肿瘤中预后最差的,通常在晚期被发现其已经出现转移。拷贝数变异(Copy number variations,CNVs)常常导致致癌因子的改变。本研究使用Affymetrix CytoScan?HD芯片检测转移性卵巢癌组织全基因组的CNVs以及杂合性缺失(Loss of heterozygosity,LOH),并筛选卵巢癌转移相关的基因,进一步分析参与卵巢癌转移过程的信号转导通路。方法:采用Affymetrix CytoScan?HD芯片分析得到所有样本全基因组的CNVs和LOH,筛选6例样本共有CNVs以及LOH片段,并与2例正常卵巢上皮组织对比,筛选差异性的片段以及基因。1.利用DAVID在线工具对候选CNVs以及LOH片段所包含的基因进行基因本体(gene ontology,GO)和信号通路显著性富集分析,全面了解候选基因在转移性卵巢癌中的作用。2.利用STRING数据库分析构建这些差异基因的相互作用通路网络,并通过Kaplan-Meier plotter在线对候选基因进行生存分析。3.利用PASTAA预测调控这些靶标基因的转录因子(Transcription factors,TFs),构建基因调控网络,找出转移性卵巢癌中发生显著变化的基因以及上游的关键转录因子。结果:1.6例转移性卵巢癌的染色体定位分析,均含有400 kb到4.9 Mb不等的染色体微结构异常,包括微缺失、微重复、杂合性缺失三种。其中,杂合性缺失最多(59.02%)。共有20个微结构异常片段包含352个基因,其中8染色体最多(34.10%)。2.6例转移性卵巢癌组织的微结构异常与2例正常卵巢上皮的比较,共筛选出可能与卵巢癌转移侵袭相关的1p33、1p21.1、1q31.3、2p11.2、3p11.1、7q31.31、10q25.1、20q11.21、Xp22.2、Xp21.1、Xq11.1等11个杂合性缺失区域和8q11.21、8q23.3、8q21.13等3个扩增区域,这些差异候选片段共含有192个基因。3.对192个基因的注释结果显著富集于转运小泡、转化生长因子受体信号通路、凋亡信号通路的正向调控、间充质细胞分化等功能。信号通路进行分析主要显著富集在碳水化合物消化吸收、淀粉和蔗糖代谢、内吞作用、慢性髓性白血病、胰腺癌等通路上。4.192个差异蛋白构成269个相互作用关系对,所形成的网络图中10个蛋白的连接度≥8,对这10个中心基因进行生存分析显示,高表达NOL4L、BPIFA3、CFH、BPIFB6、SUN5、COMMD7、SH2D6、BPIFB3与卵巢癌总体存活率较差相关(P<0.05)。5.通过PASTAA分析,预测出OCT1、CEBPA、MEF2、STAT4、P75、HNF6、ESRA、POU2AF1等7个卵巢癌差异基因的相关转录因子(p<0.01),其中卵巢癌的关键基因CFH、COMMD7是7个转录因子的共同的靶基因。结论:1.卵巢癌存在高频率的基因组CNVs,可能是卵巢癌高侵袭转移能力的相关因素。1、2、3、7、8、10、20、X号可能是转移性卵巢癌高频率异常的染色体,尤其是8号。2.全基因组CNVs芯片筛选出多个卵巢癌相关基因,这些基因可能参与了卵巢癌的转移机制。具有调控作用的一些转录因子(如OCT1、CEBPA等),可能在卵巢癌的转移过程中具有调控作用。3.本研究检测到的CNVs以及LOH片段中可能包含癌基因或抑癌基因,尤其是CFH和COMMD7,可能作为卵巢癌特征性的生物标志物,为今后卵巢癌的研究提供了新的线索和方向。