人类基因组计划前所未有的揭开了人及几种重要模式生物的遗传密码,为医学研究提供了重要的生物学资源,对探索人类遗传、发育和进化的规律具有重要意义。人类基因组中3号染色体的片段重复比例最低,其包含数千个蛋白编码基因,涉及肾癌、3p缺失综合征等上百种疾病。自上世纪90年代以来,3号染色体一直是人类基因组研究领域的热点。本文从微卫星的角度出发,通过研究其在人类3号染色体上的分布差异和特征,挖掘微卫星在人类基因组结构和功能中潜在的生物学作用。微卫星在人类基因组中广泛存在,表现出高度的遗传多样性,并与多种神经系统疾病和癌症有关,常被用作遗传标记。但人类基因组中微卫星的分布并不均匀,这种现象的深层含义有待探究。本文结合微卫星密度微分算法和相关工具对人类3号染色体微卫星的分布特征进行了系统研究,并建立起1Kbp分辨率的微卫星位置相关的密度特征图谱。通过图谱,本文发现人类3号染色体存在大量的微卫星局部高密度聚集。随后本研究通过程序和数据库注释对这种分布特征进行深入探索,发现（AT）n在其中起主导作用,并挖掘出大量微卫星高密度聚集具有的潜在生物学关联。本研究建立的3963张位置相关的微卫星密度特征图谱清晰地展示了人类3号染色体内部微卫星的分布特征和差异。通过对图谱中高密度峰的分析,发现部分微卫星经过漫长的演化以高密度聚集的方式固定在人类3号染色体中,其可能具有某些重要作用,以维持基因组结构和功能的稳定。本研究进一步挖掘了包含（AT）n在内的微卫星高密度聚集与基因组结构和功能之间的潜在关联。本文为深入研究人类3号染色体微卫星的分布特征,以及背后蕴含的生物学意义提供参考,同时为其它基因组微卫星的研究提供方法和思路。