我国西部极端环境中高糖菌株的分离筛选及新种微生物分类学研究

来源 :北京化工大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:yingzi1100
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本课题研究对象为我国西部几种不同的极端环境中分离筛选出的微生物。通过对青藏高原冻土区分离出的两株疑似新种微生物使用多相分类学的方法进行研究。参照亲缘关系较近且具代表性的标准菌株,对新种进行系统发育分析,表型分析以及化学分类分析,使其确立分类学上的位置。通过对新疆艾丁盐湖区和沙漠区域采集的环境样本进行针对性的微生物筛选处理,分离出多株耐高糖菌株。菌株AT分离于青藏高原昆仑山脉永久冻土区,是一株Polymorphobacter属的新种,表现为革兰氏阴性,严格好氧且含有细胞叶绿素α。细胞无运动性,呈短棒状,形成棕褐色菌落。根据光的吸收峰结果,检测到菌株细胞中含有类胡萝卜素和两种不同的光吸收化合物,分别为LHI和B800-835型LHII化合物。表现为过氧化氢酶阳性,氧化酶阴性。菌株细胞中主要脂肪酸类型为summed feature 3 (C16:1ω7c and/or C16:1ω6c),C17:1ω6c and summed feature 8 (C18:1ω7c and/or C18:1ω6c)。主要极性脂类型为磷脂酰甘油,磷脂酰乙醇胺,神经鞘糖脂类,双磷脂酰甘油,一种未知糖脂和一种未知磷脂。主要泛醌类型为Q-9,还含有少量的Q-10。菌株AT与已知菌株Polymorphobacter multimanifer JCM 18140T系统发育关系最近,两者16S rRNA基因序列相似度为97.5%,DNA.DNA杂交相似度(△Tm)为12.4℃。菌株AT基因组GC含量为67.4 mol%。因此菌株AT作为一个新种被发表,命名为Polymorphobacter fuscus sp. novo模式菌株AT (=CGMCC 1.12714T=JCM 19740T)。同时,也提出了关于Polymorphobacter属的描述修正。菌株BT分离于中国可可西里盆地,是一株革兰氏阴性,棒状,无运动性,不生成孢子,需氧型,菌落呈橘红色细菌。菌株BT最适生长条件为25℃,pH7.0~7.5,0-1%(w/V)的含盐量。基于16S rRNA基因序列的系统发育学分析显示菌株BT与菌株Sphingomonas fennica DSM 13665T达序列相似度最高值(97.1%),属于Sphingomonas属。菌株BT与菌株Sphingomonas fennica DSM 13665T DNA-DNA杂交同源性为45.3%。基因组GC含量为65.3 mo1%。菌株细胞中Q-10作为主要呼吸醌。主要极性脂类型为神经鞘糖脂类,双磷脂酰甘油,磷脂酰甘油,磷脂酰乙醇胺,磷脂酰胆碱和一种未知糖脂。主要脂肪酸类型为C18:1c07c和C16:1097c。根据多相分类结果显示,菌株BT为Sphingomonas属的一株新种,命名为Sphingomonas arantia sp. nov。模式菌株BT (=CGMCC 1.12702T=JCM 19855T)。沙漠环境样品(4#和5#)难以筛选出耐高糖菌株,而盐湖区的环境样品(1#、2#和3#)在高糖创造出的高渗环境中,能够筛选出一定数量的菌株,并且耐高糖菌株大部分属于芽孢杆菌属。
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