芦荟属(Aloe)植物种类繁多，变异多样，种质资源异常丰富。由于芦荟和近缘属间杂交可育，不断出现一些新的属间杂交种；且芦荟属内同名异种和异名同种现象多有发生，造成不同种或亚种间的亲缘关系比较混乱，而有关其种问亲缘关系的研究资料甚少。本文综合应用AFLP分子标记、植物化学和形态解剖学等方法，建立适合于芦荟属植物分类的方法和实验技术，并初步探讨其种间的亲缘关系。本文主要研究结果如下： 1．提取芦荟基因组DNA时用改良CTAB法，在2％CTAB中附加2％的PVP和2％的β-巯基乙醇作为提取缓冲液。同时在第二遍用氯仿一异戊醇(24：1)抽提时，加入等体积的饱和酚。 2．对影响AFLP体系的多个因素进行优化，结果表明Mg<2+>浓度取1.3mM，引物浓度各取10uM，模板DNA即预扩增产物稀释20倍时，选择性扩增的效果较为理想。 3．用4对引物组合对18份芦荟材料进行AFLP分析，共得到131条可统计的条带，其中多态性条带有125条，占条带总数的95.4％，每对引物都可以将18份供试材料完全区分开。此外，有些供试样品可根据特征带直接鉴别。基于AFLP所得聚类图可以将18种芦荟分为四个类群。第Ⅰ组包括适意芦荟、17号芦荟、皂叶芦荟和木锉芦荟；第Ⅱ组包括草原芦荟、粉绿芦荟、5号芦荟、不夜城芦荟、12号芦荟和4号芦荟；第Ⅲ组包括库拉索芦荟、木立芦荟和中华芦荟；第Ⅳ组包括8号芦荟、杰克逊芦荟、多齿芦荟、大卫芦荟和密刺芦荟。 4．HPLC结果表明，18种芦荟样品中的化学成分在种类和含量上均有较大差异。用半薄切片观察芦荟叶片横切面发现，芦荟表皮角质膜的厚度、表面纹饰，同化组织细胞的层数、形状和排列方式存在明显的种间差异。 5．AFLP标记与HPLC的聚类结果有一定的相关性，但是也存在一些差异，两者采用了不同的分类变量，从不同的角度对芦荟进行聚类分析，因此它们所揭示的多样性是有差别的。AFLP分类结果与形态学特征基本吻合，形态学标记有一定的局限性，但是它可以作为DNA分子标记的有效补充。 6．AFLP和HPLC两方面的实验结果都体现了库拉索芦荟和中华芦荟的独立性，不应该把中华芦荟划分为库拉索芦荟的变种。