经济责任审计是一项具有中国特色的审计制度,是指在确认财政、财务收支以及资产、负债、权益真实性、合法性、效益性的基础上,对领导干部在任职期间执行国家财经法纪情况、经济效益指标的完成情况及对国有资产保值增值的真实性、合法性和效益性进行审计。作为针对领导人员本身的监督机制,经济责任审计在加强权力制约、落实深化改革、促使领导干部依法行政、稳步推进党风廉政建设等方面发挥了重要作用。本文以政府审计免疫系统论为理论基础通过对A省供销总社负责人经济责任审计项目全流程进行了分析,通过对审计项目中政府审计免疫系统的揭示、预防和抵御三大功能实现情况进行研究,指出了目前对事业单位负责人经济责任审计活动中所存在的问题。进而分析出妨碍政府审计免疫系统功能实现的主要障碍,包括审计时效性低、经济责任审计内容未突出重点、审计活动完成度不足、审计评价指标构建机制不完善、审计定责不准确、审计结果未公开及审计建议未体现效果等。最后对上述问题逐个进行分解,结合审计实践的基础分别提出了以下建议:明确经济责任审计活动中需要突出的内容审计重点,试行购买社会审计服务,优化审计力量分配,提高审计时效性,坚持先审后离制度,完善审计评价指标构建机制,准确进行责任划分,加大审计处罚力度,完善审计结果公开制度,优化审计意见等。最后对政府审计目前存在的独立性不足提出了政府审计体系的制度改革的意见。本文将政府审计免疫系统论所提出的政府审计几大功能融入经济责任审计实务中,基于该理论提出了改进当前A省事业单位领导干部经济责任审计活动的一些具体措施,期望能够为经济责任审计的研究提供一定参考与借鉴。