电子商务网站系统质量的提高有益于互联网各个行为主体的活动，能够促进我国互联网经济和信息化建设的发展。本文以此为目的，进行了电子商务网站质量评价的基础理论分析，模型方法构建和实证研究。 本文先进行了以“电子商务”和“网站评价”两个关键概念为核心的文献综述研究，在对电子商务相关概念的梳理过程中界定了本文的研究对象；在对各种网站评价方法的分析归纳过程中明确了本文质量评价方法的设计和应用模式。 本文从电子商务网站交易过程视角和系统功能视角出发对电子商务网站系统进行描述，经过分析两种电子商务网站系统描述方法的统一性，将两者进行结合，得出电子商务网站的理论模型——电子商务网站动态模型。该模型规定了电子商务网站质量评价指标体系的框架结构，既能够实现指标体系在不同模式的电子商务之间的兼容，也能够为各项指标的数据测量起到在对应网页中指示出确切位置的作用。 在此基础上，本文得出用电子商务网站各项机制的功能完整性指标构建成的质量评价指标体系。分析并设计了电子商务网站质量的评价方法的全部过程，包括数据测量、标准化处理、指标体系构建、权重设置与评价四个步骤。 在对基于功能完整性的电子商务网站质量评价方法进行的实证研究中，首先以农博网为例，进行了针对单个网站的个体实证研究，得出农博网网站系统质量的优势和劣势；然后对中国网络购物行业的31个站点进行了行业性实证研究，得出各个网站自身的优劣势和整个行业的网站质量状况。针对上述情况，本文提出了相对应的建议。