ceRNA作为EMT调控网络核心因子的系统性研究

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上皮间充质转化(EMT)在癌症转移中是一个必然发生的发展过程,且与癌症相关的死亡超过90%都是与转移过程有关。EMT过程和上千个基因的变有关系的,在这个过程中可以通过下调上皮细胞标志物,如CDH1;和上调间充质细胞标志物,如CDH2、VIM、FN1来定性。MicroRNAs(miRNAs)是普遍存在的转录后的调节因子,它们可以影响RNA的稳定性且通过与靶基因内的互补位点配对后(通常称为miRNA的反应元件,MREs)影响其翻译效率。MiRNAs与它们的RNA靶基因之间的相互作用是通过多对多关系定性的,也就是说单个miRNA可以抑制大量的RNA靶基因;单个RNA也可以包含有大量的可以与miRNA相互作用的MREs。所以,许多RNAs在它们的MREs上有重要的重叠。因此,就提出了竞争性RNA的假说;这个假说表明RNAs可以通过竞争一个有限的miRNAs池来相互调节。理论分析已经表明ceRNA交互可能调节必要的生物学过程且已有报告功能性的ceRNAs调节关键的生物功能及对疾病如癌症是有利的。然而,现在经常缺乏对miRNAs和其相互作用的ceRNA的绝对定量值研究以及它们之间的化学计量学关系对基于ceRNA调节的来说是重要的研究。因此,在生理条件下对ceRNAs存在是否有作用就产生了很大的挑战。本论文,我们验讫了在TGF-β诱导EMT过程中ceRNA的动态变化。我们观察到TGFBI,一个在A549细胞诱导EMT过程中高表达的转录本,可以作为miR-21的ceRNA来调节细胞EMT过程。我们进一步确定了在MCF-10A细胞经典的SNAIL-ZEB-miR200调解回路中,FN1也可以作为miR-200c的ceRNA。绝对定量数据也显示诱导的TGFBI和FN1的表达远远超过它们靶mi RNAs的表达。实验也证明动态诱导的ceRNAs对诱导EMT来说是十分重要的。我们做了更深入的研究表明,miRNA和ceRNA的化学计量学关系可以作为细胞由EMT向MET转变的一个重要的临界参数。本论文结果有利于建立ceRNA间的生理学相关性;也表明ceRNA是EMT调解回路中重要的组成部分及可以作为一个普遍的靶目标去干扰EMT过程。
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