家鹅mtDNA序列结构与遗传多样性分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiansilang2006
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本研究采用PCR和DNA测序技术测定了6个中国家鹅品种和2个欧洲鹅品种25个个体线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)部分序列,分析了序列的相似性及雁属鹅种间的遗传多样性、2个tRNA基因(tRNAPro、tRNAThr)的二级结构和细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)跨膜螺旋结构及序列的变异特征。结果表明:得到的家鹅线粒体DNA1401bp序列包括ND5基因部分序列77bp、细胞色素b基因全序列1143bp、tRNAThr全序列68bp和tRNAPro全序列69bp;线粒体DNA1401bp序列与基因库中白额雁(Anser albifrons)、钻水鸭(Aythya americana)的序列相似率分别为97%、88%,灰雁和鸿雁家鹅Cyt b的氨基酸序列与白额雁的相似率分别为99.7%和100%,表明本次实验所测序列是真实可靠的;2个tRNA基因三叶草结构的氨基酸臂、反密码子环在鸿雁、灰雁和白额雁种间没有发生变异;家鹅Cyt b基因的核苷酸序列在膜内、膜间和膜外的变异位点数分别为12、9和10,膜内、膜间的变异均属同义替换,而膜外有两个位点发生了非同义替换,表明跨膜螺旋的膜外区域变异程度高于膜间和膜内,但膜间亲水氨基酸的比例为5.26%,远小于膜外(鸿雁16.58%、灰雁16.31%)和膜内(17.38%);8个家鹅品种25条序列(1401bp)共检测到22个变异位点,3种单倍型,单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.547和0.00775,核苷酸平均差异数为10.86;支持家鹅具有两种不同起源的观点;用线粒体DNA细胞色素b及相邻的tRNA作为分子标记,能准确检测出雁属鹅种间的遗传变异,却不能检测出种内品种间的遗传多样性。
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