农业合作经济组织是指农民在农村地区建立的、提供农业服务的各种合作制社团及其联合组织,可以克服小农经济的不足,改善农村社区治理,加强政府调控能力。但在自身因素和行政、制度、市场等外部因素影响下,仍存在注册管理不规范、体制机制不健全、合作水平不够高等问题,影响了其作用的发挥。本文旨在探索农业合作经济组织在新形势下的发展思路,通过文献研究、访谈、实地考察、案例分析与经验总结等研究方法,对相关概念进行辨析,分析农业合作经济组织的作用原理,回顾我国农业合作经济组织的发展历史,总结存在的问题和原因,并总结国外的先进做法。本文认为,随着改革的深入和生产水平的提高,农业合作经济组织呈现出成员异质化、金融合作、全要素合作等趋势,我国应从加强合作培训教育、改善外部环境、完善内部治理等入手,因地制宜的发展多元化的基层农业合作经济组织,增强其联合,以农业合作经济组织系统为骨架构建现代综合农业体系。