鲫鱼GABAA受体β3亚基基因的克隆与分析

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Y-氨基丁酸受体(GABAR)主要存在于脊椎动物和非脊椎动物的中枢神经系统(CNS)中,是氟虫腈、阿维菌素、硫丹和林丹等杀虫剂的作用靶标,也是治疗癫痫、酒精中毒、精神分裂症与帕金森氏症等疾病的医药作用靶标,所以受到国内外学术界的高度重视。实验研究表明阿维菌素、氟虫腈等农药对鱼类等水生生物为,?毒,本实验旨在克隆、纯化鱼类GABA受体亚基,并结合生物信息学与化学生物学手段研究其氨基酸序列和立体结构信息。本文运用生物信息学方法在NCBI基因组数据库中找到已经公布的GABAa受体因序列,通过多序列同源比对寻找高度保守区,根据高度保守区设计特异性引物,运用RT PCR和RACE PCR技术,成功地克隆鲫鱼、Carassius受体(33基因的全长cDNA序列,并被GenBank收录(登录☆KC964110),该基因长2767bp.开放阅读框(ORF)为1506bp,编码502个氨基酸,与已知的其他物种p3亚基具有高度的相似性。通过qRT-PCR扩增检测到该基因在鲫鱼不同组织器官差异性表达。我们以线虫体内对阿维菌素敏感的谷氨酸门控氯离子通道受体蛋白的a亚基(PDB3RHW)作为模板,用DS(DiscoveiyStudio)模拟鲫鱼GABAa受体p3亚基的同源五聚体结构,优化结构模型并与农药配体做小分子对接,计算其作用模式和结合能力。研究鱼类GABAa受体恥亚基与农药分子的作用,阐明提高GABA受体拮抗剂类农药对鱼类安全性的分子作用机理。为进一步研究GABAa受体(33亚基与药物的作用和鱼类GABA受体的克隆奠定了一记的基础。
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