中国四大国有商业银行在进行股份制改造后，建设银行、中国银行、工商银行都成功完成上市，正在向国际规范化的银行体制迈进，如何真正能够成为具有核心竞争力的商业银行，摆在各商业银行面前。 本文从商业银行组织结构研究入手，分析了发达国家商业银行的组织结构的设立，并对苏格兰皇家银行的组织结构作了深入剖析，对中国银行的组织结构调整提出方案意见，改变以往行政区域划分的，实行职能型“块块”管理总分行组织结构的模式，转为以业务的垂直条线管理为主，压缩中间环节，缩减管理半径。并以此为切入点，分析了商业银行在进行组织结构重组时，对于其内部清算支付体系模式构建的影响，并以四大国有商业银行之一中国银行的组织结构及支付体系作为研究对象，论述了目前中国银行支付体系现状产生的原因及弊端，阐明了在商业银行组织结构重组后，在全行数据大集中的系统整合后，取消系统内部支付清算，实行全行一本账的管理体系，同时取消商业银行各分支机构与当地人民银行之间建立清算模式，建立起总行对总行的方式建立清算账户，依托先进的信息技术手段，提高商业银行在支付体系中的流动性管理水平，进而控制支付性风险，提高资金效率。 本文观点是作者对中国银行进行深入研究后所形成，希望能够在国有商业银行的在机构重组及业务流程再造方面提供一定思路。