海军舰艇编队C~3I系统是一个具有使用环境特殊、组成多样和状态不确定等特性的复杂军用电子信息系统。由于Petri网理论本身具有很多特征与C~3I系统建模要求相吻合，因此成为C~3I系统建立模型的有效工具。有色Petri网是在普通Petri网理论基础上发展起来的一种高级Petri网，可以用来对复杂离散事件系统进行建模设计、规范描述、仿真和验证等。本文简单介绍了Petri网和有色Petri网的基本知识，对海军舰艇编队基本知识、C~3I系统含义及其特点进行了说明，引入了CPN Tools建模和仿真分析工具，阐述了有色Petri网在舰艇编队C~3I系统中的建模原理及方法。利用CPN Tools对所建立的模型进行了仿真运行，并对系统时延问题进行了分析。通过建模及分析得到了这样的一个结论，即对于舰艇编队这样一个复杂的离散事件系统，可用CPN来建模表达，且模型简单清晰；当预先规定一些规则(如优先级)，则会改变系统的决策性能，使系统的作战效费比优化。