随着社会经济的发展,慈善组织在当前社会的作用越来越显著,作为社会保障体系的一个部分,作为缓解社会矛盾的一个重要途径,慈善事业发展势头迅猛,1993年-2001年间,全国共出现了172家慈善组织。2000年12月,国务院发布的《关于完善城镇社会保障体系建设试点方案》中明确指出“大力发展慈善机构、服务与贫困家庭的基金会等非营利机构”;“十五”计划首次将“发展慈善事业,加强对捐助资金使用的监管”写入中国国民经济与社会发展计划;十六大、十七大报告中均有发展慈善事业的相关表述。2008年12月,胡锦涛更是在中华慈善代表大会上的讲话中强调,“慈善事业是改善民生、促进社会和谐的崇高事业”,把发展慈善事业与建设社会保障体系、构建社会主义和谐社会、树立社会文明新风、全面建设小康社会这些党的根本方针和国家发展宏伟目标紧紧联系在一起。但是在慈善组织的运作和发展过程中所产生的问题也是明显的。半官方的运作体制,使我国慈善组织的发展遭遇瓶颈。研究慈善组织与政府间的关系成为当前学术界的一个热点。本文选取从资金运作的角度,对当今我国慈善组织和政府的关系进行研究,从资金的筹措和资金的使用管理两个方面进行探讨。并认为在半官方的运作模式下,慈善组织的自愿性、民间性、社会性的基本属性被抹杀,其社会合法性受到质疑,直接影响了慈善资金的募集和使用管理。半官方的资金运作模式已不适应当前的慈善组织发展,政府应主动进行让渡,逐步放开对慈善资金的掌控,与慈善组织建立新型的合作伙伴关系,完善慈善法规和监督评估体系,实现社会资源的充分调动,达成慈善组织良性运营的目标。