在目前的医疗系统中，广泛应用血液蛋白分析作为病情诊断的重要参考手段。利用生物芯片进行血液蛋白检测和分析、诊断病情是目前国内外一种新的方法和手段，它的优点是能较早地发现病情，以便及时地治疗和控制病情，为治愈病情提供了时间保证。本文结合生物芯片进行血液蛋白检测、分析的特点和要求设计了一个血液蛋白自动检测、分析和控制系统，使它能在机械系统平台的基础上，自动进行生物芯片血蛋白检测和分析。若本系统能在医疗系统推广应用，将能大大提高医疗系统血液蛋白检测自动化水平，大幅改善医院疾病检测的精度和速度，减轻检测人员劳动强度。 本文主要讨论了生物芯片血液蛋白分析中的三个方面问题。一是生物芯片与血液蛋白发生杂交反应过程的自动化，批量化实现。二是杂交过程的恒温控制。三是对反应结果的检测，扫读与分析。 要实现生物芯片血液蛋白检测过程的自动化，必须设计一套工控机控制的机械系统以自动地进行生物芯片与血液样本的反应操作。本文提出了一个包含四个机械臂的机械操作平台，并设计了配套的运动控制逻辑与控制程序。 对于杂交反应过程的恒温控制问题，本文设计了基于珀尔贴制热（冷）器和工控机的温度控制硬件系统，采用改进的神经网络智能PID算法，取得了良好的效果。 在对生物芯片进行检测结果扫读与数据分析的问题上，本文设计了一个结构简单，成本适中的CCD图像扫描系统，配合工控机上的图像处理与分析程序，能够快速，准确的完成反应结果的检测，扫读与结果分析。 本文最后给出了系统及其各个子系统的实验和调试运行结果，其数据证实本系统能够顺利进行各项操作，自动批量完成各类测试任务。温度控制系统，运动控制系统，图像采集与分析系统均运行良好，能够获得准确测试结果。