西瓜土传枯萎病是西瓜生产中的主要限制因子之一，生物防控是其理想的防控方法之一。本研究利用具有自主知识产权的拮抗菌多粘类芽孢杆菌(Panibacilluspolymyxa SQR-21)和绿色木霉(Trichoderma viride)与优质堆肥研制的一种西瓜专用生物有机肥(bio-organic fertilizer简称BIO)，采用盆栽试验和室内分析相结合的方法，探讨了施用西瓜专用生物有机肥(BIO)防控西瓜土传枯萎病的效果及对西瓜根际土壤微生物区系的影响，获得以下结果:　　 1、营养钵育苗时，施用BIO的西瓜苗地上部干物质质量分别是施用普通有机肥(OF)和施用化肥(CF)的2.59倍和2.15倍，西瓜苗根系干物质质量分别是OF和CF的2.14倍和1.56倍，差异显著。施用BIO的西瓜苗根系总根长、根系表面积、根系总体积、根尖数和根平均直径数量均显著高于OF和CF。　　 2、在连续4季西瓜盆栽试验中，西瓜土传枯萎病的发病率随栽培季节的增加而不断增大，与单施化肥处理(CC)比较，BIO能显著防控西瓜土传枯萎病的发生，其中以营养钵和盆钵土壤中均施BIO的处理(BB)防病效果最好，最高防控率为63％。　　 3、西瓜种植中持续施用BIO能够改变西瓜根际土壤微生物区系。与CC比较:PCR-DGGE结果表明，连续4季施用BIO处理的西瓜根际土壤的细菌群落显著增加，真菌群落大量减少;454测序结果表明，施用BIO处理的细菌相对丰度大，细菌种类多。　　 4、在连续4季西瓜盆栽试验中，同一处理相比较，西瓜根际土壤中细菌、放线菌和多粘类芽孢杆菌的数量随栽培季节的增加而呈下降趋势，不同处理相比较，施用BIO的处理西瓜根际土壤中细菌、放线菌和多粘类芽孢杆菌的数量下降较慢，BB下降最慢;在连续4季西瓜盆栽试验中，同一处理相比较，西瓜根际土壤中真菌和尖孢镰刀菌数量随栽培季节的增加呈上升趋势，不同处理相比较，施用BIO的处理西瓜根际土壤中真菌和尖孢镰刀菌数量上升较缓慢，其中BB上升最慢。　　 总之，施用生物有机肥，能够促进西瓜植株生长，改善西瓜根际土壤微生物区系，有效防控西瓜土传枯萎病的发生。