科学规范的现代预算制度,其表现之一便是政府的预算与决算间不应出现太大的偏差。从预算权威性和法定性的角度看,预算偏离是一种“不合规”的现象。国务院和财政部多次发文要求降低预算偏离度,这可以看作是为了加强预算的“合规性”。而公共财政的核心目标是合理利用有限的公共资源,充分发挥财政支出的效率。那么,加强预算支出的“合规性”,会对财政支出的“效益性”造成怎样的影响呢?同时,作为国家治理内生的“免疫系统”,国家审计对预算偏离与财政支出效率之间的关系又会产生怎样的影响呢?这些疑问有待深入的探讨。文献综述部分,本文梳理了财政支出效率的衡量方法和影响因素、预算偏离的原因和后果以及国家审计功能和其对财政职能履行的作用相关文献。现有文献中,未有学者从资金使用效率角度研究预算偏离现象,也没有人将预算偏离、国家审计和财政支出效率放在同一个框架下进行研究,这为本文的写作提供了空间。本文基于委托代理理论、“免疫系统”理论、信号传递理论和威慑理论,对预算偏离、国家审计与财政支出效率的关系进行了理论分析,并使用《中国财政年鉴》《中国统计年鉴》和《中国审计年鉴》中地方政府相关数据,构建DEA-Tobit模型进行了实证分析。结果表明:（1）预算偏离与财政支出效率呈现显著的正相关关系。预算偏离并不只是预算执行能力的指标,更在一定程度上反映了资金使用的损失浪费情况。随着预算偏离度的降低,预算合规性加强,但为了使得预算完成度更高,无效支出的程度也越发加剧,从而导致了资金使用效率的下降。（2）曝光效应加强了预算支出“合规”与“效率”之间的矛盾,而威慑效应和抵御效应则对预算偏离与财政支出效率的关系无显著影响。造成这一现象的原因是:当前我国国家审计重视合规性,对绩效性的关注程度不高,反而“诱导”了无效支出,加剧了预算支出“合规性”与“效率性”的矛盾。同时,国家审计各功能之间的协同作用还有待加强,所以审计威慑效应和抵御效应未发挥应有的作用。因此,我国应推动全面预算绩效管理改革,加强国家审计工作对绩效的关注,注重审计各功能之间的协同作用,以财政支出绩效为导向,加大对揭露问题之后的审计处理处罚力度和建议力度。