【摘 要】
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组蛋白H3K4甲基化修饰被认为是真核生物中一种重要的表观遗传学标记。Complex ofproteins associatedwith Set1（COMPASS）是酿酒酵母中唯一的 H3K4 甲基转移酶复合体。随着物种进化,COMPASS复合体的种类和数量也随之增加。这类复合体以Trithorax蛋白为核心酶,广泛参与到胚胎发育和肿瘤发生等多种生物学过程。COMPASS复合体中组蛋白甲基转移酶的催
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组蛋白H3K4甲基化修饰被认为是真核生物中一种重要的表观遗传学标记。Complex ofproteins associatedwith Set1（COMPASS）是酿酒酵母中唯一的 H3K4 甲基转移酶复合体。随着物种进化,COMPASS复合体的种类和数量也随之增加。这类复合体以Trithorax蛋白为核心酶,广泛参与到胚胎发育和肿瘤发生等多种生物学过程。COMPASS复合体中组蛋白甲基转移酶的催化活性以及位点特异性受到复合体中其他亚基的调控,因此研究COMPASS复合体的亚基组成为人们理解COMPASS复合体活性调节以及基因特异性转录调控机制提供重要了线索。酵母、果蝇和人中的COMPASS复合体组分已经得到纯化和鉴定。植物中COMPASS的部分保守核心亚基被报道参与植物生长发育,开花调控和胁迫应答等多个关键生物学过程,但植物中的COMPASS复合体至今未被纯化,其完整的亚基组成一直是领域内的研究空白。本研究通过亲和纯化结合质谱分析技术鉴定到拟南芥中Trithorax同源蛋白ATX1-ATX5参与的三类COMPASS复合体。我们将其命名为ATX1/2-COMPASS Ⅰ复合体,ATX3-COMPASS Ⅱ复合体和ATX4/5-COMPASS Ⅲ复合体。每一类复合体除包含COMPASS三个核心亚基外,还包含一个独特的H3K9去甲基化酶家族的JmjC结构域蛋白。突变体表型观察,转录组测序以及H3K4me3 ChIP-seq分析显示不同的COMPASS复合体在植物生长发育和基因转录调控中的功能部分冗余。atx1/2/3/4/5纯合突变体致死证明3种COMPASS复合体对于植物生长繁殖必不可少。ATX1/2与ATX4/5调控RdDM途径关键组分NRPE1以及DNA去甲基化酶ROS1,DML2和DML3的转录,从而调控拟南芥中DNA甲基化平衡。本研究还鉴定到拟南芥中的INO80染色质重塑复合体,并发现一种植物中特有的 ATX4/5-COMPASS-INO80 复合体结合模式。JMJ24 在连接 ATX4/5-COMPASS 和INO80复合体以及维持ATX4/5蛋白稳定性中发挥重要作用。突变体表型观察,转录组测序以及H3K4me3 ChIP-seq分析显示ATX4/5-COMPSS Ⅲ与INO80的N端结合蛋白在植物生长发育和基因表达调控中的功能具有一致性,且ATX4/5-COMPSS Ⅲ与INO80协同促进其共同靶基因的表达。本研究填补了植物中COMPASS复合体以及INO80复合体亚基组成的知识空白,为进一步探究COMPASS复合体的组装,酶催化活性的调节以及靶点特异性奠定了基础。本研究首次揭示ATX蛋白不仅在植物生长发育过程中有重要调控功能,而且在维持基因组DNA甲基化状态的平衡中也起到重要作用。植物中特有的ATX4/5-COMPASS-INO80复合体的发现或许能为研究染色质重塑与H3K4甲基化的协同调控功能提供新的研究方向。
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研究背景左心室致密化不全（left ventricular noncompaction,LVNC）是一种相对罕见的以左心室肌小梁突出、小梁间巨大隐窝形成为表现的遗传性心肌病。自1990年LVNC首次被命名以来,30年间人们对该疾病的诊断方面取得了一定进展,但对其发病机制、治疗和预后仍存在诸多未知。目前对于LVNC的大宗病例研究相对匮乏,单中心大样本量的临床分析对提高该疾病的认知,不断总结和改进对该
背景:手术创伤和麻醉性镇痛药可引起术后疼痛敏感性增加,被称为术后痛觉过敏（postoperative hyperalgesia,POH）。POH是外科术后患者出现严重疼痛的主要原因。既往研究显示,术前睡眠障碍会降低机体的痛阈,增加非心脏手术患者术后中重度疼痛的发生率。然而,对于心脏外科手术患者,术前睡眠障碍是否会增加POH及术后中重度疼痛的发生风险,目前循证医学证据不足。因此,本研究旨在探索心脏外
食管鳞状细胞癌（简称食管鳞癌）是我国发病率较高的消化道恶性肿瘤。食管鳞癌的发生通常经历长期、慢性的进展过程,在形成浸润癌之前,不典型增生的食管上皮细胞限于黏膜层内生长,称为上皮内瘤变,是目前公认的鳞状细胞癌前病变的病理学形态。根据不典型增生细胞的占比,又可将其分为低级别和高级别上皮内瘤变（LGIN和HGIN）。LGIN往往进展缓慢,甚至有可能转归,但是HGIN到浸润癌则进展迅速。此外,相同诊断的不
树鼩隶属于攀鼩目,与啮齿类动物相比,树鼩与人类的系统发育关系更加密切,已成为一种新型实验动物,乳腺肿瘤在树鼩中属于一种高发肿瘤,现已成功诱导树鼩构建乳腺肿瘤动物模型,因此,树鼩是一种研究乳腺肿瘤发生机制的理想实验动物。乳腺导管内乳头状瘤主要由导管上皮细胞的异常增殖引起,由于其与异型性,乳腺导管内原位导管癌和乳腺癌的关联和潜在进展,它被归类为高风险的前体病,此病具有一定的癌变率,利用树鼩开展自发性乳
目的:寻找差异表达的泛素结合酶E2,筛选出其相关的E3泛素连接酶,研究该E3泛素连接酶在肺腺癌中的表达水平及其临床意义,并验证该泛素连接酶E3在肺腺癌中的作用。方法:1、通过ONCOMINE、UALCAN、HPA、The Kaplan-Meier plotter[lung]、cBioPortal和GEPIA等多个数据库,筛选出有差异表达的E2泛素结合酶,并验证该E2泛素结合酶的临床意义。通过该E2
背景内脏动脉动脉瘤虽然发病率较低但是破裂概率很高且难以预测,因而对内脏动脉动脉瘤的研究具有临床价值。血流动力学在临床的应用主要集中于大动脉中,在中小动脉研究方面颅内动脉和颈内动脉动脉瘤方面的研究是当前热点之一,从动脉瘤产生、生长、破裂到治疗方式选择的探讨已经非常成熟,然而在内脏动脉方面,血流动力学的应用却很少。目的1.对真实患者影像数据分析探究影响内脏动脉动脉瘤成因的流体力学参数;2.利用理想模型
背景肺神经内分泌肿瘤（PNETs）是一种特殊的肺癌亚型,包括小细胞肺癌、大细胞神经内分泌癌、非典型类癌和典型类癌。PNETs的临床表现和影像学特点不具特异性,易误诊,其治疗以手术切除为主,而辅助治疗对晚期患者有一定治疗价值。然而,PNETs的发生发展并不容易预测,因为其组织病理学价值的局限性以及能够有效预测预后的组织学或血液生物标志物的数量较少。因此探索新的生物预测指标很有临床意义。炎症细胞、免疫
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背景卵巢癌是妇科肿瘤中致死率最高的癌症,目前筛查和早期诊断策略有限。循环肿瘤DNA（ctDNA）携带肿瘤突变信息,在多种癌症诊疗中有潜在应用价值。但对其在卵巢癌早期诊断中的作用尚缺乏探讨。材料与方法研究纳入54例上皮性卵巢癌和50例卵巢良性疾病患者。收集详细的临床病理信息,使用基于338个癌症相关基因的探针进行高通量靶向捕获测序。以了解卵巢癌及良性疾病患者细胞游离DNA（cfDNA）浓度、ctDN