基于mtDNA数据探讨齿蟾属物种间系统发育关系

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齿蟾属(Oreolalax)隶属于两栖纲(Amphibia)无尾目(Anura)角蟾科(Megophryidae)拟髭蟾亚科(Leptobrachiinae),目前该属共记录18个物种,其中17个物种属于中国特有物种,主要分布于中国西南山区(四川盆地周缘山区及毗邻地区),只有越南齿蟾(O.sterlingae)分布在越南北部。线粒体基因组(mt DNA)由于具有进化速度快、无组织特异性、母系遗传、无重组、分子量小易获得等特点而被广泛用于两栖动物的分子系统发育研究。一方面,先前报道的齿蟾属7个物种线粒体基因组,未能详尽地比较分析线粒体的进化特征。因此有必要全面地对齿蟾属相关物种线粒体基因组进行比较分析。另一方面,本研究通过测定线粒体基因和和核基因RAG1重建齿蟾属物种的系统发育关系。本文获得以下结果:1.首次测定并分析峨眉齿蟾(O.omeimontis,17,675 bp)和魏氏齿蟾(O.weigoldi,17,266 bp)两种齿蟾的线粒体基因组全序列。同时测定秉志齿蟾(O.pingii,15,570 bp,Dloop区和4个t RNA未测全)、大齿蟾(O.major,15,758 bp,Dloop区未测全)和无蹼齿蟾(O.schmidti,18,481 bp,Dloop区未测全)共三种齿蟾的部分线粒体基因组序列。2.将本实验测定的两种齿蟾线粒体基因组序列与已公布的7种齿蟾的线粒体基因基因组序列整合分析发现:齿蟾属线粒体基因组的基因顺序与已经公布的齿蟾属物种排布方式基本一致,都包含13个蛋白质编码基因(PCG),2个核糖体基因、23个t RNA和1个控制区(Dloop),其中t RNA-Met为双拷贝。齿蟾属物种的蛋白质编码基因使用最多的起始密码子是ATG,大部分t RNA都可以折叠成典型的三叶草结构。线粒体基因组长度变化较大,范围在17,110 bp(乡城齿蟾)-18,676 bp(红点齿蟾)。3.本文通过测定齿蟾属内7个物种21个个体的线粒体12S r RNA,16S r RNA及t RNA-Val基因并结合Gen Bank中已发布的角蟾科内的线粒体基因重建齿蟾属内16个物种和一未知物种的系统发育关系并讨论了相关物种的分类地位,本论文首次通过分子证据确定魏氏齿蟾(O.weigoldi)在系统发育树上的位置,与利川齿蟾、秉志齿蟾和无蹼齿蟾聚为一大枝。此外,发现采自四川省彭县的宝兴齿蟾(O.popeii)与采自四川省峨眉山的宝兴齿蟾(O.popei)并没聚为一支,推测可能为同一物种,要澄清相关问题,下一步研究需要整合宝兴齿蟾模式产地(四川省宝兴县)的信息,还需要在未来的工作中进一步深入讨论。4.本文通过测定齿蟾属物种的6个物种21个个体,并结合Gen Bank中已发布的序列重建齿蟾属内13个物种的系统发育关系并讨论了相关物种的分类地位。研究结果表明齿蟾属与齿突蟾(Scutiger)亲缘关系较近,互为姐妹群。
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