动物的肠道中共生着数量庞大、结构复杂的微生物群落,它们与宿主的生理功能密切相关,发挥着重要作用。研究表明,肠道微生物能够促进动物个体发育过程中物质的消化吸收、新陈代谢、肠道组织发育、免疫功能等许多关键生理活动的进行。然而,已有研究多集中于圈养动物（鱼类、鸡和猪等）和少数野生动物（鸟类、灵长目等）,对自然生境中蝙蝠个体发育过程中肠道微生物的变化以及母蝠与幼蝠肠道微生物的关系,目前尚不清楚。东方蝙蝠（Vespertilio sinensis）隶属于翼手目（Chiroptera）、蝙蝠科（Vespertilionidae）、蝙蝠属（Vespertilio）。拂晓前及黄昏时两次外出觅食,以昆虫为食。本研究采集不同年龄阶段的东方蝙蝠幼蝠粪便,利用16S r RNA扩增子测序技术,探究东方蝙蝠个体发育过程中肠道微生物的群落结构及功能的变化,结合环境温度、年龄、身体质量指数等因素,揭示其对东方蝙蝠个体发育过程中肠道微生物群落组成的影响。同时探究新生幼蝠与母蝠的肠道微生物的关系。研究结果如下:1.东方蝙蝠幼蝠个体发育过程中,肠道微生物的多样性发生了变化。α多样性从第一周到第四周逐渐增加(R²=0.2285,P_adj=0.01),在第五周和第六周显著下降(单因素方差分析;P_adj<0.05),并在之后保持多样性的稳定。2.东方蝙蝠个体发育过程中,肠道微生物群落的β多样性发生了显著地变化(非参数多元方差检验:P_adj=0.001)。第一周到第四周的大多数个体呈现“聚拢”情况;而第五周和第六周与一到四周的个体相比能够明显区分开来。新生幼蝠个体的聚类与其他时期略有不同。3.东方蝙蝠在个体发育过程中,肠道微生物在门水平上相对稳定,其中厚壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）是菌群群落的主要组成成分。属水平的热图分析结果显示:随着个体发育的进行（第一周到第四周）,东方蝙蝠的肠道微生物群落组成逐渐相似,而在第五周至第六周之间的群落组成具有相对较低的丰度。出乎意料的是,第一天的群落组成不同于其他时期,其中乳酸球菌属（Lactococcus）,假单胞菌属（Pseudomonas）和环丝菌属（Brochothrix）的丰度相对较高。而其他时期的高丰度细菌在第一天则相对较少。4.东方蝙蝠个体发育过程中的食性转变期为第四周,食物物种鉴定结果表明:东方蝙蝠的食物组成主要由鞘翅目和鳞翅目（分别占总OTU的38%和26%）组成。然而,PICRUSt功能分析结果表明,食性转变期（第四周）前后个体的肠道微生物的所有功能类别在第2级和第3级分类水平上没有显著的差异(Benjamini-Hochberg校正;P_adj>0.05)。可能由于我们的数据与使用的PICRUSt现有数据库之间的定性和定量差异所致,我们并未获得有用的预测功能概况信息。5.冗余分析表明,所有因素能够解释肠道微生物群落结构变异的19.6%。年龄和身体质量指数（BMI）显著影响东方蝙蝠的肠道微生物的群落结构(年龄:P_adj=0.006;BMI:P_adj=0.024),而环境温度没有对肠道微生物产生显著的影响(P_adj>0.05)。其中,年龄对肠道微生物的群落结构影响最大,贡献群落结构变异比率为12.1%,其次是BMI占9.5%。6.新生幼蝠的α多样性显著高于母蝠(Kruskal-Wallis检验;P_adj<0.05);母蝠与新生幼蝠具有显著不同的肠道微生物群落(非参数多元方差检验;P_adj=0.001)。这可能暗示了新生幼蝠的肠道微生物的来源主要是由环境决定的。总体而言,本研究表征了东方蝙蝠个体发育过程中肠道微生物组成与结构,深入探索了肠道微生物群落的变化及其影响因素,研究结果有助于我们理解自然生境中蝙蝠个体发育过程中肠道微生物的变化及作用,为研究和保护蝙蝠的种群繁衍和发育提供了新的见解。