伴随着创新驱动战略的实施,中国的R&D投入也日益增加。但值得注意的是,既有文献对中国R&D活动与全要素生产率关系的讨论仍然存在不小争议。这主要是由于,现阶段中国大量的R&D经费投入似乎并没有带来全要素生产率的显著提高和经济增长质量的提升,中国面临了一定程度上的“科技创新困境”。同时,以多次“降准”为代表的内部不确定性和以中美经贸摩擦为代表的外部不确定性因素叠加,使得创新环境更受冲击,这都在一定程度上揭示中国目前存在的科技创新难题。本文认为,改善这一困境的关键在于明确科学研究和试验发展这两类研发活动对经济的不同作用。本文通过使用中国省级面板数据进行实证检验后发现:(1)从整体层面上看,在短期内,试验发展会促进全要素生产率发展,而科学研究的影响效应则不显著;在长期,试验发展会负向影响全要素生产率发展,科学研究正向影响全要素生产率发展。(2)异质性研发对全要素生产率的作用存在地区差异。门槛回归结果显示,高地区经济发展水平下试验发展投入对地区全要素生产率的正向效应弱于地区经济发展水平低的地区。(3)经济政策不确定性提升对发挥R&D支出对全要素生产率的作用存在消极影响。两步系统GMM回归结果显示,经济政策不确定性会削弱试验发展经费支出对全要素生产率的正向作用,其对科学研究的消极作用也会随着不确定的持续而不断加强。上述研究结果表明中国目前应该加大对科学研究投入的倾斜力度,同时创新活动投入也要因地制宜、因时施策,在维持稳定的经济政策环境的同时实现创新驱动。