从水稻中的高度分枝（称为圆锥花序）到大麦（Hordeum vulgare）和小麦（Triticum spp.）中更紧凑的穗状花序,花序的形状因作物而异。然而,关于指定作物花序结构的分子基础知之甚少,尤其是大麦和小麦。为了更好地了解大麦花序发育的分子机制,本项研究选取大麦主茎顶端分生组织的三个分生组织阶段:小穗起始,花器官分化和花器官生长,并与营养组织2周龄幼苗对照,对其进行转录组、小RNA和降解组测序。主要结果如下:1.本研究发现潜在的关键调节因子在三个生殖阶段的动态表达,并具有时期特异性表达模式。对4,888个转录相关基因进行共表达聚类分析和GO功能富集分析,发现早期花序发育时期转录因子,组蛋白修饰和细胞周期进展相关基因高表达,在花器官生长期间光合作用和代谢活性相关基因表现活跃。我们还观察到在花序发育期间VRS（SIX-ROWED SPIKE）基因和激素（生长素,赤霉酸和细胞分裂素）生物合成基因在二棱大麦和六棱大麦之间的动态表达模式。2.通过对大麦花序发育重要阶段small RNA的测序结果,结合降解组和RNA-seq数据,利用生物信息学技术,鉴定出当前已知的109个大麦miRNAs和870个novel miRNAs。miR159、miR166等花器官发育相关的miRNAs在大麦花序中高表达,其靶基因在大麦发育中的表达模式与miRNA趋势相反,说明miRNA介导的调控机制可能在大麦和其它作物之间具有保守性。对109个已知miRNAs和870个novel miRNAs进行聚类分析,发现绝大多少miRNA具有阶段特异性,优先在某个阶段高表达。靶基因功能富集分析表示,其主要参与花药发育、激素响应和生长等功能。对miRNAs及其靶基因的调控网络进行分析,揭示了大麦花序发育期间miRNA的调控范围。综上所述,本研究揭示了大麦花序发育时期特异性表达miRNAs和基因,提出了一个控制大麦主茎顶端分生组织活性和花发育的调控网络,为进一步揭示穗发育的分子机制提供了重要信息来源。