部门利益化是当前我国行政机构运行的一个显著特征，并且已经成为我国经济增长最大的制度性障碍。本文试从新制度学派的视角对部门利益化作一分析。首先归纳总结了新制度学派的主要观点和方法论，并阐述了制度与集体行为、权力结构之间的关系。在此基础上，本文考察了我国现行的主要制度安排和权力结构，以及由这样的安排和结构所决定的我国政府部门的集体行为。之后，本文归纳出部门利益化的制度成本以及制度诱因。部门利益化造成了我国政治、经济制度运行的高昂成本。官僚制、审批一收费制、行政垄断和财政体制是部门利益化的主要制度诱因。本文认为要将部门去利益化，必须进行制度创新并归纳、分析了几种制度创新的模型。在此分析基础上，本文尝试对有关主要制度安排进行创新与完善，希望借此可以遏制部门利益化并最终去利益化。