杏和李树上发生的类病毒种类鉴定与序列分析

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lzfx_521
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对采自北京、湖北、河北、山东、陕西、黑龙江、山西、吉林、甘肃、内蒙古、广西、新疆、福建13个不同省(市)的61个杏样品、68个李样品进行类病毒的检测与序列分析。首先从以上样品中提取低分子RNA,然后运用斑点杂交、正反向聚丙烯酰胺凝胶电泳、生物学检测、RT-PCR等方法进行检测。结果表明:杏有8个样品带有啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd),分别来自北京、河北、陕西、吉林4个省市,感染率为13.1%;李有15个样品带有HSVd,分别来自北京、内蒙古、河北、山西、吉林5个省市,感染率为22.1%。但是采集的所有杏和李的样品均不带有桃潜隐花叶类病毒(Peach latent mosaic viroid,PLMVd)。本研究是HSVd在中国杏和李树上的首次报道。 分别从检测呈阳性的8个杏样品和15个李样品中挑取3个杏样品和4个李样品进行HSVd的克隆、测序分析,并与GenBank中己报道的HSVd序列进行比较分析,结果表明: 1.从中国杏和李树上分离得到的HSVd序列变异较小,特别是中央保守区几乎没有变化,且序列变异与地域、寄主等无明显相关性。 2.从HSVd的自然寄主李PB21‘黑宝石’中,首次发现了该类病毒的分子内自然重组现象,在碱基位置244与245之间插入了与碱基位置230-244的序列完全一样的15个碱基),命名为HSVdD-15。 3.本研究在GenBank中共登录23条HSVd序列,其中来自杏的有7条(登录号:DQ362901,DQ362904~05,EF076818~21),来自李的有16条(登录号:DQ648600~01,EF076822~35)。
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