所谓不起诉也就是说公诉机关对于尚不能构成犯罪、依法不应当被追究刑事责任或者说证据不充分、不符合法律规定的起诉条件的犯罪嫌疑人所作出的不将其提交到法院进行审判的诉讼决定。为了满足日渐丰富的刑事个别化的需求和诉讼经济效益化的需要,不起诉制度自设立之日起就在不断完善,使得其既能够在控制犯罪上发挥作用,又能够满足司法效益的需求。不起诉制度切实促进了我国社会主义法治的建设,维护了法律的威严与权威,有利于实现刑事诉讼法的司法目的和时代使命。但在实践中检察机关对不起诉制度的运用仍存在一定问题,其中之一就是对同样作为案件当事人的被不起诉人权利保护的不完善。分析当前被不起诉人在我国司法实践中的地位和权利保护情况,可以发现我国司法实践中仍然存在被不起诉制度缺乏被不起诉人的参与、检察机关不起诉权的滥用、被不起诉权的申诉权难以保障以及被不起诉人无法享有公正的审判权等种种问题,由此入手可以发现不起诉制度在运行过程中对于同样作为案件当事人的被不起诉人合法权益保障存在缺位。因此应当通过增加不起诉人对案件的参与度或者完善不起诉听证制度来增加不起诉程序的透明度;也可以通过增强检察官的个人职责和内部外部的监督制约来细化对不起诉权行使的制约;此外还应当完善现有申诉制度、赋予被不起诉人选择被审判的权利,等等,由此来进一步细化相关规则,完善不起诉制度,使其能够更好地适应当前的社会情况,更好地发挥其功能和效用,保障被不起诉人应有的权利。