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壳囊孢属(Cytospora Ehrenberg.)真菌是引起树木腐烂病的重要病原。本研究通过显微形态、组织病理学以及分离物培养性状观察等方法,对采自黑龙江、吉林、辽宁、以及内蒙古东部等23个地区、15种寄主的149份枝枯病和腐烂病标本进行观察,并结合应用rDNA-ITS序列所构建的系统发育树,分析了我国东北地区壳囊孢属真菌种类,同时对该属真菌的分类依据及其种间系统发育关系进行了讨论,结果如下：(1)形态观察发现采自东北地区的壳囊孢属真菌的无性型的形态种包括Cytospora pruinosa (Fr.) Sacc., C. leucostoma (Pers.) Sacc., C. nivea Fuckel. C. chrysosperma (Pers.) Fr., C. carbonacea Fr和C. sacculus (Schwein.) Gvrit.以及Cytospora sp.1(寄主：榆树)、Cytospora sp.2(寄主：山刺玫)等8个种；有性型形态类型为Leucostoma niveum (Hoffm.) Hohn.、Leucostoma persoonii (Nitschke) Hohn.、 Leucostoma sp.(寄主：榆树)、Valsa sp.1(寄主：榆树)和Valsa sp.2(寄主：山刺玫)。(2)形态学和系统发育分析发现壳囊孢属真菌分生孢子器单腔或多腔、孔口数量、中柱以及黑色基线的有无等可作为壳囊孢属分种的主要依据,而孔口形状、子座形态、内子座发育程度等特征不稳定。迷宫状、玫瑰花座状等腔室形状以及孔口形状等即使在同一个种类也容易出现多种形态类型,因而也不适合作为分种的依据。同时像C. leucostoma等种类的内子座组织的发育程度在不同寄主中有差异,有的发育良好,但在有些寄主上发育不明显。(3)系统发育树中,同一壳囊孢物种聚在同一个分支中,且有良好的支持率；而同属于相同有性型属的壳囊孢物种所在的分支距离较近。同时形态学物种与系统发育树分支间有良好的对应性。(4)壳囊孢属真菌的寄主选择性不严格。同一种壳囊孢可寄生在不同的寄主植物上,同一种寄主植物上也可以有多种壳囊孢存在。