Y220C突变影响p53C蛋白质结构稳定性的分子机理与抑制剂筛选

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p53是迄今发现的突变频率最高的一种肿瘤抑制蛋白质,其对癌症的发生和发展有着重要的影响。p53的突变会导致其抑癌功能丧失,从而诱导癌症的发生。大约1/3的突变体是结构突变体,其中Y220C是研究较多的一种突变体。该突变会加剧p53蛋白质变性而发生聚集。本文首先利用分子动力学(MD)模拟方法研究了p53C蛋白质突变体Y220C(p53C-Y220C)的结构变化,发现虽然p53C-Y220C整体稳定性与野生型p53C差异不大,但Y220C突变会造成突变体周围的Y220C cluster区域稳定性降低。进一步分析发现,Y220C突变会导致该蛋白质分子内氢键数目降低,从而破坏Y220C cluster的原有的Beta-折叠结构,进而降低该蛋白质的稳定性。MD模拟结果揭示了Y220C突变对p53核心结构域造成的结构影响,为恢复Y220C突变体高效稳定剂的筛选和设计奠定了坚实的基础。为了获得该突变体的稳定剂,本文依次利用利宾斯基5原则和分子对接从DrugBank 4.0数据库中筛选获得了3个潜在的稳定剂分子。然后利用全原子MD模拟进一步验证这3个分子和目标蛋白质之间的亲和作用。结果发现只有他克林能够紧密结合到Y220C突变所形成的疏水空腔之中。进一步分析表明,他克林和目标蛋白质之间的主要作用力为疏水和静电相互作用,其中疏水相互作用占主导地位。他克林分别与目标蛋白质的残基Leu145,Asp228和Val147形成3个氢键。并基于MD模拟轨迹详细分析了他克林与p53突变体Y220C的结合过程。本研究通过内源荧光,ThT荧光方法研究了p53C-Y220C蛋白聚集的动力学特性。并且研究了小分子塔克林和EGCG对p53C-Y220C蛋白聚集的抑制作用,通过ThT荧光和TEM表征了EGCG对p53C-Y220C蛋白聚集的影响。结果表明,p53C-Y220C蛋白在37°C下会出现颗粒状聚集,一定浓度的EGCG对p53C蛋白质的聚集有抑制作用。
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