论文部分内容阅读
目的研究长链非编码RNA(The long non-coding RNA,Lnc RNA)PCAT1基因遗传变异与汉族人群膀胱癌发病风险的关联性。背景在我国及西方国家,膀胱癌是发病率最高的泌尿系统肿瘤。虽然说在中国,相比其他的发病疾病,该种疾病的发病率要显著低于消化系统、恶性肿瘤等疾病的发生率,但是膀胱癌的发病率在我国呈明显的上升趋势。饮食结构的改变和社会老龄化趋势与膀胱癌的高发密不可分,开展对膀胱癌的发病机制的深入研究也显得越来越重要了。根据之前学者们的研究我们可以看出,因为基因变异导致的细胞异常跟膀胱癌疾病的发生具有高度相关性,但是随着学者们对肿瘤的研究脚步逐渐深入,研究者逐渐发现,在调控恶性肿瘤发病过程中,表观遗传学调控机制起到了至关重要的调节效果。随着人类基因组计划的进行,大量的研究已经发现基因关键位置的遗传变异对基因的结构、表达以及分子调控功能产生重要的影响,进而导致机体部分生物学调控功能的改变。研究发现LncRNA PCAT1在泌尿系统肿瘤的发生发展中起到重要作用。研究发现许多单核苷酸多态性在LncRNA中可影响各类肿瘤的生物进程。本实验旨在PCAT1多态性与膀胱癌易感性的关联性研究。研究方法本研究共纳入1606例膀胱癌患者和2386例正常对照(GWAS研究中有578例患者和1006例对照),第二阶段TaqMan基因分型研究中采用包括1028例膀胱癌患者和1381名健康对照。对候选LncRNA PCAT1的4个TagSNPs与膀胱癌发病风险之间的关联性进行分析。本实验分两个阶段的病例-对照研究(GWAS阶段,随后是Taqman基因分型阶段)分析候选LncRNA PCAT1的4个TagSNPs与膀胱癌的发生密切相关,我们通过多因素非条件性logistic回归分析计算出比值比(ORs)及其95%的可信限(CIs),评价各SNPs变异与膀胱癌发病风险之间的关联性。结果全基因组关联研究(GWAS)和第二阶段基因分型分别引入了578/1006和1028/1381个研究对象(病例/对照)。在GWAS阶段,我们发现位于PCAT1内含子上的rs710886 A>G与膀胱癌风险显著相关(OR=0.86,P=0.046)。接下来,我们发现在可加性模型(additive model)中,与携带AA基因型的患者相比,具有GG和GA基因型的个体具有更低的膀胱癌风险(调整后OR:0.83,95%CI:0.74-0.93,P=0.0013)。G的等位基因显示出对膀胱癌的显著保护作用(调整后OR:0.80,95%CI:0.67-0.96)。此外,分层分析显示,老年人膀胱癌风险有更显著的降低趋势(60岁以上;调整OR:0.77,95%CI:0.67-0.88)。结论本研究揭示PCAT1 rs710886多态性对膀胱癌风险的重要作用。PCAT1rs710886有望成为用作预测膀胱癌风险的生物标志物。本研究有望为进一步揭示LncRNAs在膀胱癌发生发展中的作用及其可能的生物学机制提供理论依据,有助于膀胱癌的病因学研究以及膀胱癌早期预防与筛查。