全球人口膨胀、经济增长和城市化进程对水资源和耕地等人类赖以生存的自然资源的耗损、生态环境的破坏使人类感到越来越大的压力,我国农业资源节约与环境友好事关经济社会可持续发展的头等大事。2012年中央一号文件三分之二的篇幅谈农业科技创新与可持续发展问题,强调要坚持产业需求导向,从农民实际需要出发,着眼长远,超前部署农业前沿技术和基础研究,力争在世界农业科技前沿领域占有重要位置的重要部署,明确了农业科技创新的价值取向是面向产业需求,突破农业重大关键技术和共性技术,切实解决科技与经济社会发展的脱节问题。本研究从我国农业科技创新的历史嬗变入手,梳理了农业科技创新与农业资源、环境之间存在的悖论与劣化问题,探索了我国农业科技创新与农业资源、环境之间无法实现经济社会问题与科技创新对接的成因,在传统农业科技创新与资源、环境之间的方针政策、法律法规、管理制度系统的不兼容性的基础上,借鉴世界经济发达国家、发展中国家及邻近类似国家的农业环境与资源科技创新与运行体制的实践经验,提出了在资源节约与环境友好要素介入农业科技创新耦合下的框架模型,探索设计了产、学、研、府、民多主体、多角度、多视野、全方面、立体式、链条螺旋性协同运行的两型农业科技创新系统。并构建了切合我国生态与生物特质(按六大区域划分)的农业资源节约与环境友好(两型)科技创新评价指标系统的育化、选择机制,对我国两型农业科技创新制度环境系统、两型农业科技创新运行系统、两型农业科技创新产出能力系统、两型农业科技创新的资源节约系统、两型农业科技创新的环境友好系统等六大系统进行了论证,构建了两型农业科技创新的评价系统,为促进两型农业科技创新提供了决策支持。嗣后,本研究根据新形势、新任务和新要求,预判两型农业科技创新在未来20-40年所面临的发展机遇与系列巨大挑战,对两型农业科技创新的深层次演进方向提出了科学定位和趋势把握。