经济全球化浪潮深深地影响着当今世界上的国家间和地区间的关系。台湾与大陆的关系也无法摆脱全球化带来的冲击,不可避免地卷入到全球化浪潮当中。从而使双边关系具备了一些新特质。但是,经济全球化并不是影响两岸关系的唯一因素,长期以来,台海与大陆关系的发展始终同台湾岛内政治要素紧密联系。这两个因素同时存在,并同时作用于两岸关系,使得两岸政治经济互动既表现出新特征,又具有历史继承性。虽然大陆和台湾都积极参与了经济全球化的过程,但是,双方参与的方式和所起的作用具有差别。具体表现之一,就是两岸产业在全球生产体系中的分工大有不同。这种分工区别既给两岸经贸关系发展带来促进,又给两岸经贸进步设置障碍。究其原因,一方面是经济全球化影响的复杂性;另一方面则是台湾政治因素在其中发挥了重要作用。台湾与大陆之间的毛巾贸易失衡,本是两岸经贸往来的一个正常现象,也是台湾与大陆产业分工发展的必然结果,但在台湾岛内政治要素的推动下,却在2005-2006年期间成为贸易争端。这给两岸经贸交流,甚至是两岸关系的进一步发展制造了困难。要想破除经济全球化时代政治经济因素对两岸关系的消极影响,既需要两岸正确认识两岸经贸发展中出现的问题,又需要积极克服各自经济中存在的困难,更需要避免将贸易争端上升为意识形态高度。未来两岸关系的发展,既无法排除经济全球化继续发挥作用,也不能彻底清除台湾政治因素的阻碍。如何协调两岸关系,利用全球化机遇推动两岸经济共同发展,还需要两岸共同努力。