利用多基因位点系统发育树鉴定新疆地区头癣致病菌的研究

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目的:探讨新疆地区头癣(tinea capitis)致病菌的基因特点,利用多基因位点系统发育树(multi-loci phylogenetic tree)鉴定新疆地区头癣致病菌,为新疆地区头癣病的预防、诊疗提供科学的依据。方法:对22株新疆地区头癣分离株的ITS、EF和Beta-tubulin基因进行PCR扩增、测序、序列分析,同时与24个CBS标准菌株的以上相关基因位点做比较,建立系统进化树,从而通过多基因系统发育树鉴定新疆地区头癣的致病菌,同时评价这三个基因位点对皮肤癣菌鉴定的优缺点,寻找出皮肤癣菌特异性的鉴定基因。以此评估出最好的基因标记物用来鉴定新疆地区头癣致病菌。结果:利用全部22株来自新疆地区头癣分离株,通过与CBS标准菌株一起构建系统进化树比较以上3个基因位点后,目前为止我们发现:在利用多基因位点构建系统进化树来鉴定新疆地区头癣致病菌的过程中,Beta-tubulin可能是最好的基因标记物。结论:通过使用ITS、EF和Beta-tubulin基因分别构建系统进化树,在新疆地区头癣分离株中我们鉴定出了7个种,它们分别是:E.floccosum;M.canis;T.ferrugineum;T.schoenleinii;T.tonsurans;T.verrucosum;T.violaceum。目前为止,在鉴定新疆地区头癣致病菌方面,我们发现Beta-tublin是最好的基因标记物。
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