【摘 要】
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正确判断脑部神经胶质瘤基因型是突变还是野生类型,将有助于医生做出正确的预后治疗。针对活体组织检查会对患者造成一定的伤害、人工观察核磁共振图像准确率低的情况,本文借助计算机辅助的方式对神经胶质瘤进行判断。本文以神经胶质瘤分型为目的,多序列核磁共振图像为数据基础,深度学习为方法,从预处理到肿瘤分型分别提出了不同的深度学习网络结构。本文的创新性工作包括以下内容:(1)针对预处理时,3D Slicer等软
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正确判断脑部神经胶质瘤基因型是突变还是野生类型,将有助于医生做出正确的预后治疗。针对活体组织检查会对患者造成一定的伤害、人工观察核磁共振图像准确率低的情况,本文借助计算机辅助的方式对神经胶质瘤进行判断。本文以神经胶质瘤分型为目的,多序列核磁共振图像为数据基础,深度学习为方法,从预处理到肿瘤分型分别提出了不同的深度学习网络结构。本文的创新性工作包括以下内容:(1)针对预处理时,3D Slicer等软件对核磁共振图像进行颅骨剥离操作费时费力且准确率低的情况,本文提出了基于各向异性空洞卷积及特征融合的核磁共振图像颅骨剥离方法AD2MNet。本网络通过结合各向异性卷积、多视图与多尺度融合方法构造了颅骨剥离神经网络,并在江苏省人民医院放射科提供的本地数据上进行了训练和测试。测试结果的Dice值、Jaccard值、PPV值和Sensitivity值分别达到了98.92%、93.75%,95.35%和97.11%。另外,本方法与BSE、BET等算法进行了对比,且做了泛化能力实验,证明了网络具有较高的颅骨剥离精度和较强的泛化能力。(2)针对活检会对病人造成伤害且人工通过MR图像判断神经胶质瘤基因型正确率低的情况,提出了基于空洞卷积金字塔ResNet网络的基因分型方法D-ResNet。此方法使用空洞卷积构造空洞金字塔模块以提高ResNet感受野。此方法通过在本地数据集和来自TCIA的公开数据集进行了训练和测试。准确率相比原始ResNet网络提高了1.52%。另外,本方法与DenseNet、MLP等算法进行了对比,且做了泛化能力实验,证明了网络准确率得到了提高和有较强泛化能力。(3)针对使用2DMR图像数据进行基因分型存在的标注耗费人工、序列特征提取不完整的情况,提出使用3D卷积、多序列图像融合输入的方法及CA注意力机制去改进网络。改进后的网络MA3D-ResNet通过在本地数据集和来自TCIA的公开数据集进行了训练和测试,相比D-ResNet网络准确率提高了10.74%。另外,通过与C3D、DensNet3D等3D卷积算法的对比实验和预测肿瘤等级的泛化能力实验得出网络具有较高的准确率和较强的泛化能力。
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