2011年3月中共中央国务院发布的《关于分类推进事业单位改革的指导意见》以促进公益事业发展为目的,将从事公益服务的事业单位按照能否实现部分资源市场配置细分为公益一类事业单位与公益二类事业单位。按照划分原则,享受财政拨款的高等学校即属于公益二类事业单位。《指导意见》的出台对提升和加强公益二类高校财务核算水平的需求日益凸现。本文立足于我国高校财务工作实际,理论与实践相结合,力争对提高公益二类事业单位的财务核算水平进行前瞻性探索。本文首先摆明公益二类高等院校财务核算现状：长期以来财务核算沿用老办法直接导致公益性收益与经营性收益相互混淆,无法区分财务成果,不符合时代发展和《指导意见》推动改革的目的。接下来提出,提升财务核算的关键是进行公益成本与经营成本的分担及确立。之后介绍了成本核算的方法及确定成本分担中的关键点：共同成本的确定及分摊。本文第三章研究了以ABC大学为例,根据收集到的数据,将2012财务成果数据按照上述成本核算程序和方法归集、分摊到公益二类事业高校的两大功能体系当中；在首先确定了经营性收入的成本负担之后,分别得到经营性收益与公益性收益的实际数据；最终体现财务核算价值与财务管理的作用。本文研究分析公益成本与经营成本的分担问题,旨在实现《指导意见》推动改革强化事业单位公益属性的目的,为提高公益二类事业单位的财务核算能力提供思路和参考。