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目的:玫瑰冠鸡肉质细嫩风味独特,巨大的桑葚状冠形更是引人注目,是弥足珍贵的家禽育种素材,有望培育成优质新疆地方品种（配套系）鸡。本研究以玫瑰冠鸡为材料,良凤麻鸡为参照,探讨影响肌肉品质相关基因的遗传特点,寻找可用于玫瑰冠鸡辅助育种的分子标记,为玫瑰冠鸡的遗传改良提供参考依据。方法:通过DNA分子标记法对玫瑰冠冠型性状进行鉴定,高效液相色谱法测定肌肉组织中AMP、IMP、HYP含量;并用实时荧光定量PCR探索H-FABP、A-FABP、ADSL基因在其生长发育阶段的时空表达规律,SSCP技术检测H-FABP、A-FABP、ADSL基因的SNPs位点,并与玫瑰冠鸡的肌肉品质进行关联分析。结果:（1）对玫瑰冠性状与单冠性状进行基因型分子鉴定发现:存在RR、RS、SS三种基因型,并用传统的测交方法对分子标记的结果进行效果评价,F1代的冠型结果表明,测交与分子鉴定的结果完全一致。（2）肌肉常规营养分析表明:玫瑰冠鸡的胸肌、腿肌IMF含量分别显著高于良凤麻鸡（P<0.05）;呈味物质测定显示:良凤麻鸡的胸肌AMP含量极显著高于玫瑰冠鸡的胸肌、腿肌（P<0.01）,IMP含量则以玫瑰冠鸡的胸肌最高,并极显著高于其腿肌以及良凤麻鸡的胸肌、腿肌（P<0.01）,且玫瑰冠鸡的腿肌HYP含量极显著高于其胸肌以及良凤麻鸡的胸肌（P<0.01）,表现出明显的品种差异。（3）qRT-PCR检测结果表明:H-FABP基因mRNA的表达量随周龄增加而减少,与两品种鸡的胸肌、腿肌IMF含量呈现负相关,但未达到显著水平;A-FABP表现为上升趋势,并与肌肉的IMF含量呈显著正相关;ADSL基因的表达则呈波动性变化,均表现为先升高后有所下降,最终表达量回升至较高水平,与肌肉的IMP含量呈显著正相关。（4）SSCP技术检测到H-FABP（T-632C、G-747A、G-896A）、A-FABP（A-1765G、G-1978A）、ADSL（A-4677G、T-5611A、C-8335T、T-15008C、G-15484A）SNPs位点,H-FABP、A-FABP基因与IMF含量的关联分析表明:T-632C、G-896A、A-1765G SNP位点对两品种鸡的胸肌、腿肌IMF含量有显著影响,AB、BB型分别为该位点的优势基因型,将两个基因的有利基因型合并后,ABBB聚合基因型的腿肌IMF含量最高,并显著高于AAAA、AAAB、BBAA型个体（P<0.05）。结论:可用分子鉴定法代替传统的测交法用于玫瑰冠鸡冠型性状的选择;玫瑰冠鸡的肌肉品质整体优于良凤麻鸡,A-FABP、ADSL基因的表达与肌肉的IMF、IMP含量呈显著正相关;T-632C、G-896A、A-1765G多态位点与玫瑰冠鸡肌肉的IMF含量存在显著关联性,其优势合并ABBB基因型聚合个体的腿肌IMF含量最高,可将这些位点作为与玫瑰冠鸡肌肉品质性状相关的分子标记,应用玫瑰冠鸡的选育。