在经济发展中，科技企业孵化器（TechnologyBusinessIncubator）是培育中小型科技创业企业的一种社会经济组织，其本质在于把知识、技术和资本有效地连接起来，提升企业家的才能，减少小企业的失败，加速新企业的发展，从而促进科技成果的商品化、产业化。因而，作为一种培育中小型企业的政策工具，科技企业孵化器已被世界许多国家和地区广泛采用，并已成为经济管理领域和众多国家与地区政府关注的焦点。　　但是，随着孵化器的飞速发展，人们对孵化器认识的不断深入，孵化器的相关研究却相当滞后，尤其是有关孵化器绩效评价的研究亟待加强，至今仍无令人信服的证据表明中国企业孵化器的绩效水平，各孵化器没有建立自我评估体系，国家也没有建立科学的评价方法以对孵化器的绩效进行客观、系统的评价，这已对企业、国家和社会造成了巨大的资源浪费。有鉴于此，本文针对我国科技企业孵化器绩效评价的理论欠缺，以及绩效评价实践中存在诸多问题这一现状，提出了一种基于“环境(Circumstance)-要素(Constituent)-过程(Course)”的“3C”系统的科技企业孵化器绩效评价的理论与方法，即基于3C系统分析框架对我国孵化器绩效评价现存问题的深入剖析，通过构建3C指标体系，并选择二次相对绩效评价方法，从而实现我国科技企业孵化器绩效评价的系统性与科学性，以期提高我国孵化器的整体绩效及其管理水平。　　本文从分析我国科技企业孵化器绩效评价的现状入手，采用系统研究的方法，全面概括了我国科技企业孵化器的产生背景、运行现状及性质特征。并在分析孵化器绩效评价运作实践、总结其取得成果的基础上，阐述了当前孵化器绩效评价中现存的诸多问题，进而基于国家、孵化器及在孵企业三个层面，深入剖析了我国科技企业孵化器现存问题对国家经济建设、孵化器发展及科技成果转化等方面的负面影响。这使我们能够准确、科学地把握科技企业孵化器的运行现状及其绩效，以便更有针对性地研究孵化器绩效评价的理论与方法，构建科技企业孵化器绩效评价体系，并最终解决其绩效评价中的现实问题。　　本文阐述了基于3C系统的科技企业孵化器绩效评价的理论基础，构建了3C系统分析框架，剖析了孵化器绩效评价中的3C因素作用机理，并据此全面分析了我国科技企业孵化器绩效评价的现存问题及其负面影响。进而依据现存问题的形成机理，采用比较分析法，在剖析现有孵化器绩效评价指标体系及其评价模型优缺点的基础上，建立了基于3C系统的孵化器绩效评价指标体系的构建思路，并就其指标的定义、权重、评分标准及分值计算等进行了较为充分的阐释。继而将该3C系统指标体系与二次相对绩效评价方法有机结合，提出了构建基于3C系统的科技企业孵化器动态绩效评价模型的新思路，构建了孵化器的绩效评价模型，阐释了其绩效评价的数据来源及测算过程。　　为了验证基于3C系统的科技企业孵化器绩效评价理论与方法的有效性和实用性，本文选取了具有代表性的孵化器作为实证分析对象，采用问卷调查及深度访谈等方法，深入剖析了科技企业孵化器绩效评价的现状，针对解决其现存问题、旨在提高其科技成果转化及区域创新能力等考虑，构建了基于3C系统的孵化器绩效评价体系，并进行了实际绩效测评。同时，基于有效应用本文提出的孵化器绩效评价相关理论与方法，全面推进我国科技企业孵化器绩效评价工作的实施，及构建国家创新体系等考虑，本文深入剖析了基于3C系统的我国科技企业孵化器绩效评价的实施效果，并依据对孵化器绩效评价未来发展趋势的理解及对实证分析的再思考，基于3C系统分别从要素因素、过程因素及环境因素三个方面对孵化器的绩效评价实践给出了具有较强针对性的政策分析与推进建议。