基于树莓派的实时数字PCR系统研制与应用验证

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数字PCR技术是检测和定量核酸的主流技术之一,其中荧光检测法是常用的数字PCR终点检测方法。由于该方法无法实现蒸发、非特异性扩增、低反应效率等反应单元的正确分类,使得核酸浓度定量结果的准确性受到影响。实时数字PCR平台的出现为提高数字PCR定量准确性提供了一种有效的途径。本文针对本研究组研制的自吸式数字PCR芯片的特点,研制了一套体积小、成本低、兼容性好的实时数字PCR系统。本文主要研究工作如下:1、设计和搭建了基于树莓派的实时数字PCR系统,该系统集成了数字PCR芯片模块、扩增反应控制模块、荧光成像模块和测控软件模块,是我们目前所了解到的体积最小,成本最低的实时数字PCR平台。2、开发了阵列式芯片实时荧光检测分析系统,由此得到的结果较终点检测法而言,提供了更具体、更准确的反应单元分类结果。3、开展了模板DNA的PCR扩增实验,并进行了平行对比实验,对系统的准确性和稳定性进行了验证。结果显示该系统上实时的结果较终点的结果有更好的数字PCR定量准确性。4、对多种阵列式芯片进行了终点荧光检测,且实现了液滴式芯片荧光图像的处理,说明该系统具有很好的兼容性和可扩展性。本系统实现了实时数字PCR系统的高度集成和低成本开发,有效提高了数字PCR定量的准确性,具有应用于实时数字PCR分析的潜力。
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