基于DCE-MRI的乳腺肿瘤异质性区域分割方法及其在Ki-67表达预测中应用

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乳腺癌是一种高发性的恶性肿瘤,美国癌症协会(ACS)数据显示,乳腺癌新增患者数量总体呈上升趋势,且一直高居女性恶性肿瘤发病率首位。通过对基因表达谱的研究发现,乳腺癌具有不同的分子亚型,不同分子亚型的患者在预后反应和生存结果上均有显著差异。乳腺癌除了个体之间的差异外,其肿瘤内部也是高度异质的。目前医院主要通过活检穿刺获取患者的病理信息,由于对肿瘤不同区域进行取样的结果可能不尽相同,给疾病诊断和治疗带来误判的隐患,并且活检穿刺对人体具有侵入式伤害,无法通过多次活检对肿瘤内部的异质性进行描述。动态增强磁共振成像(Dynamic Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Imaging, DCE-MRI)技术因其软组织高分辨率和动力学信息被广泛应用。本论文利用 DCE-MRI的动力学信息,对乳腺肿瘤异质性区域分割方法进行研究,对肿瘤内部的异质性进行描述。Ki-67是乳腺癌诊断治疗和预后评价的重要指标之一,所以本文通过乳腺肿瘤的异质性研究对 Ki-67表达进行预测。  目前,乳腺DCE-MRI影像特征与Ki-67表达的关联研究主要都针对整个肿瘤进行分析,异质性区域特征与基因表达的关联研究甚少。本论文通过乳腺DCE-MRI动力学参数的不同,对肿瘤进行异质性区域分割和异质性描述,同时对异质性区域与整体肿瘤区域进行对比分析,探讨定量的异质性区域研究是否能够实现对 ER阳性患者 Ki-67表达更加准确的预测,具体研究内容如下:  (1)数据筛选:结合本论文的研究目的对数据进行筛选,统计实验样本的基本信息,包括年龄、绝经情况、病灶大小等,通过卡方检验和方差分析研究患者基本信息对 Ki-67表达的影响。  (2)影像处理与特征提取:利用计算机半自动方法对DCE-MRI提取病灶区域,通过DCE-MRI的动力学信息对肿瘤进行异质性区域分割,分割依据有:1)达到峰值时间(Time to Peak, TTP);2)峰值增强率(Peak Enhancement Rate, PER);3)动力学模式聚类(Kinetic Pattern Clustering, KPC)。对分割后的异质性区域和整体肿瘤分别提取纹理特征、形态特征、统计特征和增强特征。其中对纹理特征进行提取时,分别提取二维纹理特征和三维纹理特征进行对比分析。  (3)基于异质性区域特征的Ki-67预测表达研究:从单变量和多变量两个角度设计逻辑回归分类模型,绘制受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve, ROC曲线)并计算对应曲线下的面积(Area Under ROC Curve, AUC)。考虑到异质性区域之间的相互联系,对异质性区域构建的分类器进行模型融合。最后利用Bootstrap计算显著性P值,分析融合后模型是否显著优于整体病灶所构建的模型,并计算精确率(Precision)、召回率(Recall)、F1-Measure和正确率(Accuracy)等指标对模型进行综合评估。  本文基于DCE-MRI对乳腺肿瘤异质性分割方法进行研究,对异质性区域特征与Ki-67表达的预测模型进行了构建。实验表明,异质性区域的纹理特征显著优于整体病灶。通过分类器融合后,异质性区域的分类模型在各个指标上均优于整体肿瘤所对应的模型。其中,利用TTP分割后的异质性区域模型,通过融合后AUC为0.922±0.030,远大于整体肿瘤的预测性能(AUC=0.802±0.053),利用Bootstrap进行显著性检验,结果显示 P-value=0.04,所以实验证明:乳腺肿瘤异质性的定量分析能够显著提高 Ki-67表达预测的准确率,可能是一个有价值的临床标志。
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