猪H-FABP基因多态性及其与肌内脂肪含量的遗传相关性研究

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本研究以肌内脂肪含量较高的中国地方猪种大河猪、大乌猪和雅南猪及三元杂交猪(DLY)为试验动物,利用PCR-RFLPs技术研究了心脏型脂肪酸结合蛋白基因(Heart Fatty Acid-binding Protein gene,H-FABP)5’-上游区和第二内含子的遗传变异,分析了H-FABP基因不同位点各基因型对肌内脂肪含量的影响。 利用PCR-RFLPs技术对H-FABP基因的多态性、基因频率和基因型频率的研究显示:在Hinf Ⅰ-RFLP位点,四个猪种都存在变异,等位基因H的频率分别为0.8000、0.5000、0.4040和0.9650;在Hinf*Ⅰ-RFLP位点,除DLY存在变异外,其余三个猪种只存在bb基因型,等位基因B在DLY中的频率是0.1960;在Msp Ⅰ-RFLP位点,四个猪种都存在变异,等位基因A的频率分别是0.8000、0.2500、0.9430和0.7960;在HaeⅢ-RFLP位点,雅南猪只存在DD基因型,其余三个猪种中都存在多态性,等位基因D的频率在大河猪、大乌猪和DLY猪中分别是0.9500、0.5000和0.1830。 在Hinf Ⅰ-RFLP位点,除DLY猪为低度多态(PIC<0.25)外,其余三个猪种为中度多态(0.25<PIC<0.5);在Hinf*Ⅰ-RFLP位点,DLY猪为低度多态(PIC<0.25),其余三个猪种在该位点没有多态性,PIC=0;在Msp Ⅰ-RFLP位点,大河猪和大乌猪为中度多态(0.25<PIC<0.5),雅南猪和DLY猪(PIC<0.25),为低度多态;在HaeⅢ-RFLP位点,大河猪和DLY猪为低度多态(PIC<0.25),另外两个猪种均为中度多态(0.25<PIC<0.5)。 在分品种(系)进行H-FABP基因与IMF含量的相关性分析中,在Hinf Ⅰ-RFLP位点,除了大河猪HH基因型(IMF含量5.0416±1.8562)与hh基因型(IMF含量12.7790+0.0000)、Hh基因型(IMF含量6.1890±0.0440)与hh基因型(IMF含量12.7790±0.0000)的IMF均值之间的差异达到极显著水平(P<0.01)外,其它猪种各基因型的IMF均值之间均差异不显著。在Hinf*Ⅰ-RFLP位点,DLY猪三种基因型的IMF平均值之间差异不显著,其余三猪种之间没有多态性。在Msp Ⅰ-RFLP位点,大河、大乌和雅南猪各基因型的肌内脂肪含量之间差异不显著(P>0.05),DLY猪AA(IMF含量1.9639±0.7317)与Aa基因型(IMF含量2.5510±0.7793)的肌内脂肪含量之间差异极显著(P<0.01)。在HaeⅢ-RFLP位点,除雅南猪没有多态性以外,其余三个猪种各基因型的肌内脂肪含量之间的差异不显著(P>0.05)。 在整个群体中进行H-FABP基因与IMF含量的相关性分析发现,在Hinf Ⅰ-RFLP位点存在hh高于Hh,Hh高于HH的规律;hh(IMF含量为5.1134±2.6847)和HH (IMF含量为2.5590月.5459)两种基因型的肌内脂肪含量之间的差异极显著 (P<0.01)。在Hin户I一RFLP位点存在bb高于BB,BB高于Bb的规律;bb和BB两种基因型的肌内脂肪含量之间差异不显著(P>0.05)。在MsPI一RFLP位点存在aa高于Aa,Aa高于AA的规律;AA(I MF含量为3.0206士2.2570)与aa(I MF含量为4.6710士1.5365)基因型的肌内脂肪含量之间差异极显著(P<0.01)。在Haelll一RFLP位点存在DD高于Dd,Dd高于dd的规律;DD(IMF含量为4.9436士2.4646)与Dd(IMF含量为2.6007士1 .5084)和dd(IMF含量为2.1604士0.9897)两种基因型的肌内脂肪含量之间的差异极显著(P<0.01)。 通过最小二乘分析发现,H~FABP基因的单倍体h树bb/A刀DD(Hinfl一hh,Hin户I一bb,Mspl一AA, Haelll一DD)具有最高的IMF均值(5.7157士2.9225),与IMF含量的最小二乘均值最大(7 .7504),与IMF的效应值最高,是最佳基因型组合。
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