DNA测序技术对于人类研究生命科学及医学有着非常重要的作用,自20世纪七十年代第一代测序技术诞生以来,DNA测序技术进展迅猛。碳纳米孔测序技术作为一种第三代测序技术,以其测序速度快,测序通量高,较低成本等特点获得了研究者们的重视。碳纳米孔技术是最有希望实现个人全基因组测序成本降到1000美元以下的技术。不同种类的碱基在电泳作用下通过碳纳米孔时产生的电流表现出差异,这构成了碳纳米孔测序技术的理论基础。本课题组以膜片钳放大器作为检测碱基电流的信号检测装置,采用USB2.0接口技术和FPGA技术设计了数据采集系统。本文在此基础上,完善了测序系统的最后一环—-碱基电信号识别算法,实现了系统从采集碱基信号到数据传输最后识别出碱基种类一套完整的流程。本文从膜片钳放大器的特性出发,分析了其作为测序系统微弱电流放大器的可行性。探究了碱基穿孔产生电信号的基本原理,建立了信号产生的电路模型,分析了信号的特性,在此基础上采用方波加白噪声模拟碱基信号。采用阈值法测定信号的两个特征值—宽度和幅值,并和信号经传统滤波器滤波后和小波去噪后再运用阈值法测定的结果做对比。运用小波变换确定信号边界,测出信号的特征值。运用聚类分析的方法对信号根据特征值进行分类,进而将每一个信号识别归类。本文研究发现,在信号不进行去噪的情况下,阈值法错误率较大。传统滤波器对信号去噪后,阈值法不能精确测定信号的宽度。信噪比为15dB下基于小波去噪的阈值法对于精确测定信号的准确度和宽度及幅度效果较好。信噪比为10dB基于小波去噪后的阈值法测量精度大幅下降,小波变换则能精确测定信号的边界,在10dB乃至2dB信噪比下精度较高。聚类分析法能很好的根据信号的特征值识别信号,并自动归为四类。