海藻糖生产菌cDNA文库的构建

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本试验通过采用热酸性酚法、TRIZOL法、经典总RNA提取法、E.Z.N.A Yeast RNA Kit法四种方法,对酿酒酵母AS2.1416的总RNA的提取进行对比研究,以期获得高质量的总RNA.并以采用SA-PMPs法从总RNA中提取的mRNA作为模版,在AMV反转录酶等一系列酶的作用下合成双链cDNA分子。进而将获得的双链cDNA分子与适当的衔接子相连后与经过酶切的具有相同粘性末端的pUC18载体连接,然后将连接后的重组质粒转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,取适量将转化后的大肠杆菌DH5α感受态细胞平铺在涂有IPTG(20%)和X-gal(2%)的LB固体平板上,从而得到酿酒酵母AS2.1416的cDNA文库。接着以扩增文库中重组质粒为模版,根据已发表的tps1的序列设计引物,进行PCR扩增,将PCR产物与tps1序列进行同源性分析。 实验结果表明:1)以A260值计算酵母总RNA产量,热酸性酚法、TRIZOL法,经典总RNA提取法、E.Z.N.A Yeast RNA Kit法总RNA三次平均产量分别为1.2μg/μl、0.48μg/μl、0.324μg/μl、1.072μg/μl。其中以热酸性酚法和E.Z.N.A Yeast RNA Kit法得率较高,每毫升培养液分别获得36μg和32.16μg RNA,其余两种方法较低,分别获得14.4μg和9.72μg RNA。而且采用热酸性酚法得到的总RNA纯度较高,其A260/A280可达1.917、A260/A230可达2.034,电泳图谱可看到3条明显条带,明显优于其它3种提取方法。2)采用SA-PMPs法能够有效地从总RNA中分离提纯mRNA,分离纯化得到mRNA的量为0.41阿,产率约为1.14%,平均A260/A2801.977,纯度较高,能够满足构建高质量cDNA文库的要求.3)将反转录合成的双链cDNA经过分级分离纯化后,测得cDNA含量20.09ng,产率约为4.9%.4)首次使用pUC18质粒载体成功地构建了酿酒酵母As2.1416的cDNA文库。该文库的重组率达到96%,库容量达到1.1*109,文库中cDNA片段大小介于0.4*103—5.5+103bp。该文库的构建为进一步在分子水平上筛选目的基因及亚克隆奠定了基础。5)通过对发表的tps1基因的分析,设计PCR引物,以构建的cDNA文库中的cDNA克隆为模版,通过PCR扩增及对其特异产物的克隆、酶切鉴定和核苷酸测序,成功地从文库中筛选并克隆到长约1.4kb的一段DNA序列,经同源性比较发现与tps1基因的同源性达到97%,具有较高的同源性,为进一步研究酵母茵体海藻糖合成机制奠定了基础,同时也证明了本实验所构建的cDNA文库的质量是理想的。
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