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阿魏酰阿拉伯木聚糖(Ferulic Acid Arabiaxylan,FAX)对面制品的加工及营养品质有重要影响,其含量高低是影响小麦加工品质的重要因素。因此挖掘FAX含量QTL位点及与FAX含量显著相关的SNP标记,对于小麦品质相关分子标记辅助育种(molecular marker assisted breeding,MAS)具有重要意义。本实验利用小麦90K SNP芯片对藁城8901/周麦16 RIL群体、166份中国黄淮麦区和90份中国北部麦区的小麦品种(系)进行FAX含量的QTL定位和全基因组关联分析。主要结果如下:1.对藁城8901/周麦16 RIL群体在不同环境下的方差分析表明:藁城8901/周麦16 RIL群体FAX含量在不同环境和基因型以及重复间差异均达到极显著水平,基因型与环境互作间无显著性差异。小麦籽粒FAX含量的广义遗传力为0.87。166份黄淮麦区和90份北部麦区小麦品种(系)的FAX含量在四个环境下均呈连续性分布,变异范围分别是2.70~4.77(10~-55 mol/L)、3.49~4.93(10~-55 mol/L)。各环境之间的FAX含量呈显著正相关,相关系数分别介于0.35~0.67、0.38~0.59之间(P<0.0001),h~2为0.79、0.82。以上结果说明,在早期世代对FAX含量性状进行选择是可行的。2.利用90K SNP芯片对藁城8901/周麦16 RIL群体进行QTL分析,发现5个主效QTL位点在多个环境下存在,分布在2AS、2BS、2DL、3AS和6AS染色体,分别命名为QFax.xjau-2AS、QFax.xjau-2BS、QFax.xjau-2DL、QFax.xjau-3AS和QFax.xjau-6A,单个QTL可解释6.2~18.2%的表型变异。其中QFax.xjau-3AS解释表型变异最大(18.2%)。QFax.xjau-2AS、QFax.xjau-3AS和QFax.xjau-6AS QTL的优异等位基因来源于周麦16,QFax.xjau-2BS和QFax.xjau-2DL的优异等位基因来源于藁城8901。3.采用覆盖小麦基因组的18,207个均匀分布的SNP标记,通过TASSEL软件的混合线性模型(Mixed-linear model,MLM)对166份黄淮麦区和90份北部麦区小麦品种(系)进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)。黄淮麦区和北部麦区分别检测到78个(分布在8个染色体区域)和32个(分布于14个染色体区域)与FAX含量显著相关的SNP标记(P<0.001),单个SNP分别可以解释6.8~9.5%、13.3~21.2%的表型变异。在显著相关的SNP位点区域分别共发现3个和2个候选基因。