中药提取物中多种活性成分和生物大分子之间的相互作用研究在中药活性成分筛选以及中药药理的建立中具有重要意义,也是中药现代化研究中的热点和难点之一。本论文首次提出了中药生物指纹谱的概念,并建立了一系列以高效液相色谱为核心的方法,实现了中药提取物中多种活性成分和生物大分子相互作用的同时定性和定量分析。建立了微透析/高效液相色谱方法,并用于中药提取物中多种活性成分和DNA分子的相互作用研究。从中药黄连、黄柏和苦参的提取物中筛选出包括小檗碱、巴马汀和药根碱在内的7种活性成分。通过这种方法还测定了这3种化合物和DNA的结合常数并研究了它们对DNA的竞争相互作用。建立了离心超滤样品预处理/高效液相色谱方法,用于定量分析中药提取物中多种活性成分对DNA结构和序列选择性。通过这种方法从中药黄连和大黄的提取物中共筛选出18种活性成分,并定量分析了它们对DNA的结构及序列选择性。制备了新型固定化DNA色谱固定相,并成功应用于中药提取物的一维和二维高效液相色谱分析以及亲和固相萃取。应用这种固定相进行了中药活性成分筛选,复杂中药提取物中活性成分的纯化,以及中药提取物的二维生物色谱分析等方面的研究。应用以上色谱方法,对中药延胡索中的天然消旋化合物四氢巴马汀与DNA的相互作用进行了研究,并发现它的(+)对映体对B构型DNA具有更强的结合能力。