菜粉蝶颗粒体病毒(Pieris rapae Granulovirus,PrGV)属于杆状病毒科、颗粒体病毒属,是一类特异感染菜粉蝶幼虫的GV病毒。本论文通过基因组测序解析了 PrGV基因组结构,对其编码的120个蛋白进行了预测。同时,利用现代分子生物学方法对PrGV 一些基因进行表达模式分析和定位研究,并结合基因组、转录组和蛋白组等数据探讨了 PrGV与宿主的相互关系。所取得的主要结论如下:1)PrGV基因组大小为108,592bp,编码120个ORF,有62个ORF在其它GV基因组中均有同源基因,可能是GV核心基因;有5个ORF与其它GV基因同源性很低,可能是PrGV特有的。PrGV与ErelGV亲缘关系最近,基因组ORFs共线性程度也很高;与HearGV亲缘关系较远,共线性程度次之;与AcMNPV基因组无明显的共线性关系。2)利用高通量测序技术建立了菜青虫感染PrGV后的转录组数据库(包括未感毒对照、感毒6h组和感毒72h组的转录组数据库),共鉴定到103个PrGV基因的表达。通过比较宿主基因在各转录组之间的表达水平变化,分别筛选到1,224个(未感毒:感毒6h)、1,638个(未感毒:感毒72h)和1,959个(感毒6 h:感毒72 h)差异表达基因。对差异表达基因进行富集并根据表达模式进行分类,发现表皮蛋白、核糖体蛋白、热激蛋白、蛋白酶体、氧化还原反应、细胞凋亡等相关基因在病毒侵染后发生显著变化,为杆状病毒-宿主互作研究提供了重要的基础数据。3)除了已知的47个ODV蛋白外,本文利用液相色谱-质谱/质谱联用(LC-MS/MS)首次在PrGV-ODV中发现PrGV_gp003和PrGV_gp076两个结构蛋白。此外,33个宿主蛋白也存在于ODV中,包括cohesin、alpha-actinin、dynactin等结构蛋白。4)利用实时定量PCR监测了 PrGV侵染菜青虫后病毒基因在宿主肠道、全虫的表达模式,发现PrGV_gp035、PrGV_gp046、PrGV_gp097、PrGV_gp0114等属于病毒的早期基因,可能在病毒感染初期发挥作用;而PrGV_gp002、PrGV_gp004、PrGV_gp020、PrGV_gp021、PrGV_gp022等是病毒晚期基因,可能参与ODV的形成,帮助病毒组装和扩散。5)利用大肠杆菌E.coli系统外源表达病毒蛋白,并制备了多克隆抗体。通过Western blotting和免疫金标记技术,成功地将PrGV_gp002、PrGV_gp020、PrGV_gp021、PrGV_gp029、PrGV_gp076、PrGV_gp086、PrGV_gp035、PrGV_gp042、PrGV_gp097、PrGV_gp114、PrGV_gp046、PrGV_gp054 等蛋白定位在颗粒体病毒的颗粒体上,其中PrGV_gp002既是ODV的重要组分,也是颗粒包涵体的成分之一。